Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3W7

SCYL2, SCY1-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCYL2Q6P3W7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCYL2Q6P3W7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCYL2Q6P3W7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCYL2Q6P3W7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SCYL2Q6P3W7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCYL2Q6P3W7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCYL2Q6P3W7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SCYL2Q6P3W7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCYL2Q6P3W7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCYL2Q6P3W7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCYL2Q6P3W7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCYL2Q6P3W7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCYL2Q6P3W7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCYL2Q6P3W7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCYL2Q6P3W7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCYL2Q6P3W7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCYL2Q6P3W7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCYL2Q6P3W7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCYL2Q6P3W7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCYL2Q6P3W7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCYL2Q6P3W7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCYL2Q6P3W7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCYL2Q6P3W7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCYL2Q6P3W7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCYL2Q6P3W7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCYL2Q6P3W7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCYL2Q6P3W7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SCYL2Q6P3W7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCYL2Q6P3W7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCYL2Q6P3W7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCYL2Q6P3W7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCYL2Q6P3W7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCYL2Q6P3W7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCYL2Q6P3W7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SCYL2Q6P3W7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SCYL2Q6P3W7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCYL2Q6P3W7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCYL2Q6P3W7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCYL2Q6P3W7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCYL2Q6P3W7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCYL2Q6P3W7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCYL2Q6P3W7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCYL2Q6P3W7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCYL2Q6P3W7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCYL2Q6P3W7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCYL2Q6P3W7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCYL2Q6P3W7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCYL2Q6P3W7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SCYL2Q6P3W7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCYL2Q6P3W7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCYL2Q6P3W7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCYL2Q6P3W7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCYL2Q6P3W7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCYL2Q6P3W7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCYL2Q6P3W7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCYL2Q6P3W7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCYL2Q6P3W7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCYL2Q6P3W7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SCYL2Q6P3W7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCYL2Q6P3W7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCYL2Q6P3W7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCYL2Q6P3W7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCYL2Q6P3W7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCYL2Q6P3W7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCYL2Q6P3W7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCYL2Q6P3W7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCYL2Q6P3W7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCYL2Q6P3W7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCYL2Q6P3W7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SCYL2Q6P3W7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCYL2Q6P3W7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCYL2Q6P3W7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCYL2Q6P3W7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCYL2Q6P3W7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCYL2Q6P3W7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCYL2Q6P3W7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SCYL2Q6P3W7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCYL2Q6P3W7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SCYL2Q6P3W7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCYL2Q6P3W7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCYL2Q6P3W7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCYL2Q6P3W7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCYL2Q6P3W7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCYL2Q6P3W7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCYL2Q6P3W7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCYL2Q6P3W7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCYL2Q6P3W7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCYL2Q6P3W7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCYL2Q6P3W7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCYL2Q6P3W7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SCYL2Q6P3W7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SCYL2Q6P3W7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCYL2Q6P3W7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SCYL2Q6P3W7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCYL2Q6P3W7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCYL2Q6P3W7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCYL2Q6P3W7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCYL2Q6P3W7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCYL2Q6P3W7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCYL2Q6P3W7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms