Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
CHIC1Q5VXU3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
CHIC1Q5VXU3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
CHIC1Q5VXU3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
CHIC1Q5VXU3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
CHIC1Q5VXU3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
CHIC1Q5VXU3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
CHIC1Q5VXU3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
CHIC1Q5VXU3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC41.57■■■■■ 4.25
CHIC1Q5VXU3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
CHIC1Q5VXU3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
CHIC1Q5VXU3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC41.55■■■■■ 4.24
CHIC1Q5VXU3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC41.55■■■■■ 4.24
CHIC1Q5VXU3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
CHIC1Q5VXU3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
CHIC1Q5VXU3 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
CHIC1Q5VXU3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
CHIC1Q5VXU3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
CHIC1Q5VXU3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
CHIC1Q5VXU3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
CHIC1Q5VXU3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
CHIC1Q5VXU3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
CHIC1Q5VXU3 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
CHIC1Q5VXU3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
CHIC1Q5VXU3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
CHIC1Q5VXU3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
CHIC1Q5VXU3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.51■■■■■ 4.24
CHIC1Q5VXU3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
CHIC1Q5VXU3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
CHIC1Q5VXU3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
CHIC1Q5VXU3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
CHIC1Q5VXU3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
CHIC1Q5VXU3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
CHIC1Q5VXU3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
CHIC1Q5VXU3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC41.5■■■■■ 4.23
CHIC1Q5VXU3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
CHIC1Q5VXU3 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC41.49■■■■■ 4.23
CHIC1Q5VXU3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
CHIC1Q5VXU3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
CHIC1Q5VXU3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
CHIC1Q5VXU3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
CHIC1Q5VXU3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
CHIC1Q5VXU3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
CHIC1Q5VXU3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
CHIC1Q5VXU3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
CHIC1Q5VXU3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
CHIC1Q5VXU3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
CHIC1Q5VXU3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.45■■■■■ 4.23
CHIC1Q5VXU3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC41.45■■■■■ 4.23
CHIC1Q5VXU3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
CHIC1Q5VXU3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
CHIC1Q5VXU3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
CHIC1Q5VXU3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC41.43■■■■■ 4.22
CHIC1Q5VXU3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
CHIC1Q5VXU3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
CHIC1Q5VXU3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
CHIC1Q5VXU3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
CHIC1Q5VXU3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC41.42■■■■■ 4.22
CHIC1Q5VXU3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
CHIC1Q5VXU3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
CHIC1Q5VXU3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
CHIC1Q5VXU3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
CHIC1Q5VXU3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
CHIC1Q5VXU3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
CHIC1Q5VXU3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
CHIC1Q5VXU3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
CHIC1Q5VXU3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
CHIC1Q5VXU3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
CHIC1Q5VXU3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
CHIC1Q5VXU3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
CHIC1Q5VXU3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC41.38■■■■■ 4.21
CHIC1Q5VXU3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
CHIC1Q5VXU3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
CHIC1Q5VXU3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
CHIC1Q5VXU3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC41.37■■■■■ 4.21
CHIC1Q5VXU3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC41.37■■■■■ 4.21
CHIC1Q5VXU3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
CHIC1Q5VXU3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
CHIC1Q5VXU3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
CHIC1Q5VXU3 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC41.36■■■■■ 4.21
CHIC1Q5VXU3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
CHIC1Q5VXU3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
CHIC1Q5VXU3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
CHIC1Q5VXU3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
CHIC1Q5VXU3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
CHIC1Q5VXU3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
CHIC1Q5VXU3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
CHIC1Q5VXU3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
CHIC1Q5VXU3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
CHIC1Q5VXU3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
CHIC1Q5VXU3 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
CHIC1Q5VXU3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
CHIC1Q5VXU3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
CHIC1Q5VXU3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
CHIC1Q5VXU3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
CHIC1Q5VXU3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
CHIC1Q5VXU3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.21
CHIC1Q5VXU3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.21
CHIC1Q5VXU3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC41.32■■■■■ 4.21
CHIC1Q5VXU3 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms