Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC58.04■■■■■ 6.88
CHIC1Q5VXU3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.42■■■■■ 6.78
CHIC1Q5VXU3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC56.62■■■■■ 6.66
CHIC1Q5VXU3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC56.5■■■■■ 6.64
CHIC1Q5VXU3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.14■■■■■ 6.58
CHIC1Q5VXU3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.12■■■■■ 6.57
CHIC1Q5VXU3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC55.85■■■■■ 6.53
CHIC1Q5VXU3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC55.49■■■■■ 6.47
CHIC1Q5VXU3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC55.36■■■■■ 6.45
CHIC1Q5VXU3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC55.3■■■■■ 6.44
CHIC1Q5VXU3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC55.01■■■■■ 6.4
CHIC1Q5VXU3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC54.84■■■■■ 6.37
CHIC1Q5VXU3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.31■■■■■ 6.28
CHIC1Q5VXU3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC54.25■■■■■ 6.28
CHIC1Q5VXU3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC54.14■■■■■ 6.26
CHIC1Q5VXU3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC53.72■■■■■ 6.19
CHIC1Q5VXU3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC53.58■■■■■ 6.17
CHIC1Q5VXU3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC53.4■■■■■ 6.14
CHIC1Q5VXU3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.39■■■■■ 6.14
CHIC1Q5VXU3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC53.3■■■■■ 6.12
CHIC1Q5VXU3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.28■■■■■ 6.12
CHIC1Q5VXU3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.26■■■■■ 6.12
CHIC1Q5VXU3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC53.1■■■■■ 6.09
CHIC1Q5VXU3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC52.9■■■■■ 6.06
CHIC1Q5VXU3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC52.77■■■■■ 6.04
CHIC1Q5VXU3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.73■■■■■ 6.03
CHIC1Q5VXU3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC52.69■■■■■ 6.03
CHIC1Q5VXU3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.63■■■■■ 6.02
CHIC1Q5VXU3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.63■■■■■ 6.02
CHIC1Q5VXU3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.56■■■■■ 6
CHIC1Q5VXU3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC52.17■■■■■ 5.94
CHIC1Q5VXU3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC52.09■■■■■ 5.93
CHIC1Q5VXU3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.94■■■■■ 5.9
CHIC1Q5VXU3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC51.88■■■■■ 5.9
CHIC1Q5VXU3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC51.84■■■■■ 5.89
CHIC1Q5VXU3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.82■■■■■ 5.89
CHIC1Q5VXU3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.82■■■■■ 5.89
CHIC1Q5VXU3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.75■■■■■ 5.87
CHIC1Q5VXU3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.75■■■■■ 5.87
CHIC1Q5VXU3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.54■■■■■ 5.84
CHIC1Q5VXU3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC51.54■■■■■ 5.84
CHIC1Q5VXU3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC51.5■■■■■ 5.83
CHIC1Q5VXU3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.46■■■■■ 5.83
CHIC1Q5VXU3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.39■■■■■ 5.82
CHIC1Q5VXU3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC51.33■■■■■ 5.81
CHIC1Q5VXU3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.27■■■■■ 5.8
CHIC1Q5VXU3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC51.25■■■■■ 5.8
CHIC1Q5VXU3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.25■■■■■ 5.8
CHIC1Q5VXU3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC51.25■■■■■ 5.79
CHIC1Q5VXU3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.23■■■■■ 5.79
CHIC1Q5VXU3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC51.2■■■■■ 5.79
CHIC1Q5VXU3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.19■■■■■ 5.78
CHIC1Q5VXU3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.14■■■■■ 5.78
CHIC1Q5VXU3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC50.76■■■■■ 5.72
CHIC1Q5VXU3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.7■■■■■ 5.71
CHIC1Q5VXU3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC50.63■■■■■ 5.7
CHIC1Q5VXU3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.61■■■■■ 5.69
CHIC1Q5VXU3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.57■■■■■ 5.69
CHIC1Q5VXU3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.54■■■■■ 5.68
CHIC1Q5VXU3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.53■■■■■ 5.68
CHIC1Q5VXU3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC50.53■■■■■ 5.68
CHIC1Q5VXU3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.51■■■■■ 5.68
CHIC1Q5VXU3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC50.37■■■■■ 5.65
CHIC1Q5VXU3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.32■■■■■ 5.65
CHIC1Q5VXU3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC50.3■■■■■ 5.64
CHIC1Q5VXU3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC50.27■■■■■ 5.64
CHIC1Q5VXU3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.22■■■■■ 5.63
CHIC1Q5VXU3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.22■■■■■ 5.63
CHIC1Q5VXU3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC50.18■■■■■ 5.62
CHIC1Q5VXU3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.17■■■■■ 5.62
CHIC1Q5VXU3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.13■■■■■ 5.62
CHIC1Q5VXU3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.1■■■■■ 5.61
CHIC1Q5VXU3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC50.03■■■■■ 5.6
CHIC1Q5VXU3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC50.01■■■■■ 5.6
CHIC1Q5VXU3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC49.95■■■■■ 5.59
CHIC1Q5VXU3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC49.94■■■■■ 5.59
CHIC1Q5VXU3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.94■■■■■ 5.58
CHIC1Q5VXU3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC49.91■■■■■ 5.58
CHIC1Q5VXU3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.87■■■■■ 5.57
CHIC1Q5VXU3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.86■■■■■ 5.57
CHIC1Q5VXU3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.75■■■■■ 5.55
CHIC1Q5VXU3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC49.69■■■■■ 5.55
CHIC1Q5VXU3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC49.64■■■■■ 5.54
CHIC1Q5VXU3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC49.63■■■■■ 5.54
CHIC1Q5VXU3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC49.53■■■■■ 5.52
CHIC1Q5VXU3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.53■■■■■ 5.52
CHIC1Q5VXU3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC49.52■■■■■ 5.52
CHIC1Q5VXU3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC49.51■■■■■ 5.52
CHIC1Q5VXU3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.5■■■■■ 5.51
CHIC1Q5VXU3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC49.43■■■■■ 5.5
CHIC1Q5VXU3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC49.43■■■■■ 5.5
CHIC1Q5VXU3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.41■■■■■ 5.5
CHIC1Q5VXU3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.35■■■■■ 5.49
CHIC1Q5VXU3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC49.33■■■■■ 5.49
CHIC1Q5VXU3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.23■■■■■ 5.47
CHIC1Q5VXU3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC49.23■■■■■ 5.47
CHIC1Q5VXU3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.14■■■■■ 5.46
CHIC1Q5VXU3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC49.07■■■■■ 5.45
CHIC1Q5VXU3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC49.05■■■■■ 5.44
CHIC1Q5VXU3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC49.05■■■■■ 5.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms