Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9A4

ATAD3B, ATPase family AAA domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3BQ5T9A4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATAD3BQ5T9A4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATAD3BQ5T9A4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATAD3BQ5T9A4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATAD3BQ5T9A4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATAD3BQ5T9A4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATAD3BQ5T9A4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD3BQ5T9A4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD3BQ5T9A4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD3BQ5T9A4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD3BQ5T9A4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD3BQ5T9A4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD3BQ5T9A4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD3BQ5T9A4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD3BQ5T9A4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD3BQ5T9A4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD3BQ5T9A4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD3BQ5T9A4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD3BQ5T9A4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD3BQ5T9A4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD3BQ5T9A4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD3BQ5T9A4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD3BQ5T9A4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD3BQ5T9A4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD3BQ5T9A4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD3BQ5T9A4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAD3BQ5T9A4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAD3BQ5T9A4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAD3BQ5T9A4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAD3BQ5T9A4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAD3BQ5T9A4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATAD3BQ5T9A4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATAD3BQ5T9A4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATAD3BQ5T9A4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATAD3BQ5T9A4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATAD3BQ5T9A4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATAD3BQ5T9A4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATAD3BQ5T9A4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATAD3BQ5T9A4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATAD3BQ5T9A4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATAD3BQ5T9A4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATAD3BQ5T9A4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATAD3BQ5T9A4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATAD3BQ5T9A4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATAD3BQ5T9A4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATAD3BQ5T9A4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATAD3BQ5T9A4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATAD3BQ5T9A4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATAD3BQ5T9A4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATAD3BQ5T9A4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATAD3BQ5T9A4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATAD3BQ5T9A4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATAD3BQ5T9A4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATAD3BQ5T9A4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATAD3BQ5T9A4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATAD3BQ5T9A4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms