Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CHD4Q14839 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CHD4Q14839 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CHD4Q14839 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CHD4Q14839 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CHD4Q14839 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CHD4Q14839 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CHD4Q14839 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CHD4Q14839 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CHD4Q14839 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CHD4Q14839 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CHD4Q14839 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
CHD4Q14839 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CHD4Q14839 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CHD4Q14839 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CHD4Q14839 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CHD4Q14839 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
CHD4Q14839 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CHD4Q14839 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
CHD4Q14839 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CHD4Q14839 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CHD4Q14839 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CHD4Q14839 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CHD4Q14839 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CHD4Q14839 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CHD4Q14839 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CHD4Q14839 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CHD4Q14839 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CHD4Q14839 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CHD4Q14839 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CHD4Q14839 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CHD4Q14839 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CHD4Q14839 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CHD4Q14839 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CHD4Q14839 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CHD4Q14839 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CHD4Q14839 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CHD4Q14839 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
CHD4Q14839 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CHD4Q14839 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CHD4Q14839 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CHD4Q14839 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CHD4Q14839 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CHD4Q14839 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHD4Q14839 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHD4Q14839 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHD4Q14839 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHD4Q14839 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHD4Q14839 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CHD4Q14839 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHD4Q14839 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHD4Q14839 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHD4Q14839 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHD4Q14839 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHD4Q14839 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHD4Q14839 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHD4Q14839 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHD4Q14839 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHD4Q14839 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHD4Q14839 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHD4Q14839 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHD4Q14839 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHD4Q14839 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
CHD4Q14839 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CHD4Q14839 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CHD4Q14839 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CHD4Q14839 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
CHD4Q14839 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
CHD4Q14839 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CHD4Q14839 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CHD4Q14839 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CHD4Q14839 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CHD4Q14839 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CHD4Q14839 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
CHD4Q14839 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CHD4Q14839 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CHD4Q14839 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CHD4Q14839 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CHD4Q14839 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CHD4Q14839 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CHD4Q14839 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CHD4Q14839 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CHD4Q14839 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CHD4Q14839 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CHD4Q14839 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CHD4Q14839 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CHD4Q14839 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CHD4Q14839 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CHD4Q14839 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CHD4Q14839 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
CHD4Q14839 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CHD4Q14839 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CHD4Q14839 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CHD4Q14839 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CHD4Q14839 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CHD4Q14839 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CHD4Q14839 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CHD4Q14839 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CHD4Q14839 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CHD4Q14839 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
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