Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIK2Q13002 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK2Q13002 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK2Q13002 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK2Q13002 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK2Q13002 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIK2Q13002 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIK2Q13002 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIK2Q13002 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIK2Q13002 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIK2Q13002 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIK2Q13002 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIK2Q13002 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIK2Q13002 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIK2Q13002 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIK2Q13002 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK2Q13002 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK2Q13002 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK2Q13002 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIK2Q13002 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIK2Q13002 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIK2Q13002 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIK2Q13002 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK2Q13002 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK2Q13002 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK2Q13002 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK2Q13002 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK2Q13002 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK2Q13002 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK2Q13002 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK2Q13002 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK2Q13002 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK2Q13002 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK2Q13002 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK2Q13002 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK2Q13002 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK2Q13002 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK2Q13002 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRIK2Q13002 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK2Q13002 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
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