Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
ARHGEF5Q12774 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
ARHGEF5Q12774 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
ARHGEF5Q12774 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
ARHGEF5Q12774 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
ARHGEF5Q12774 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
ARHGEF5Q12774 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
ARHGEF5Q12774 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
ARHGEF5Q12774 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
ARHGEF5Q12774 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
ARHGEF5Q12774 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
ARHGEF5Q12774 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC37.07■■■■□ 3.52
ARHGEF5Q12774 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
ARHGEF5Q12774 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
ARHGEF5Q12774 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
ARHGEF5Q12774 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
ARHGEF5Q12774 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
ARHGEF5Q12774 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
ARHGEF5Q12774 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
ARHGEF5Q12774 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
ARHGEF5Q12774 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
ARHGEF5Q12774 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
ARHGEF5Q12774 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
ARHGEF5Q12774 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
ARHGEF5Q12774 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
ARHGEF5Q12774 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
ARHGEF5Q12774 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
ARHGEF5Q12774 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
ARHGEF5Q12774 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
ARHGEF5Q12774 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
ARHGEF5Q12774 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
ARHGEF5Q12774 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
ARHGEF5Q12774 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
ARHGEF5Q12774 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
ARHGEF5Q12774 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
ARHGEF5Q12774 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
ARHGEF5Q12774 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC37■■■■□ 3.51
ARHGEF5Q12774 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ARHGEF5Q12774 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
ARHGEF5Q12774 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ARHGEF5Q12774 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
ARHGEF5Q12774 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC37■■■■□ 3.51
ARHGEF5Q12774 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
ARHGEF5Q12774 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
ARHGEF5Q12774 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
ARHGEF5Q12774 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
ARHGEF5Q12774 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
ARHGEF5Q12774 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
ARHGEF5Q12774 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
ARHGEF5Q12774 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
ARHGEF5Q12774 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
ARHGEF5Q12774 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
ARHGEF5Q12774 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
ARHGEF5Q12774 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
ARHGEF5Q12774 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
ARHGEF5Q12774 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
ARHGEF5Q12774 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
ARHGEF5Q12774 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
ARHGEF5Q12774 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
ARHGEF5Q12774 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
ARHGEF5Q12774 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
ARHGEF5Q12774 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
ARHGEF5Q12774 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
ARHGEF5Q12774 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
ARHGEF5Q12774 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
ARHGEF5Q12774 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
ARHGEF5Q12774 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
ARHGEF5Q12774 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
ARHGEF5Q12774 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
ARHGEF5Q12774 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
ARHGEF5Q12774 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
ARHGEF5Q12774 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
ARHGEF5Q12774 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
ARHGEF5Q12774 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
ARHGEF5Q12774 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
ARHGEF5Q12774 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
ARHGEF5Q12774 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
ARHGEF5Q12774 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
ARHGEF5Q12774 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
ARHGEF5Q12774 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
ARHGEF5Q12774 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
ARHGEF5Q12774 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
ARHGEF5Q12774 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
ARHGEF5Q12774 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ARHGEF5Q12774 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
ARHGEF5Q12774 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
ARHGEF5Q12774 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ARHGEF5Q12774 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ARHGEF5Q12774 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ARHGEF5Q12774 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
ARHGEF5Q12774 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
ARHGEF5Q12774 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
ARHGEF5Q12774 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ARHGEF5Q12774 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ARHGEF5Q12774 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
ARHGEF5Q12774 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ARHGEF5Q12774 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
ARHGEF5Q12774 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
ARHGEF5Q12774 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
ARHGEF5Q12774 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
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