Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RASGEF1BQ0VAM2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RASGEF1BQ0VAM2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RASGEF1BQ0VAM2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RASGEF1BQ0VAM2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASGEF1BQ0VAM2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASGEF1BQ0VAM2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASGEF1BQ0VAM2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASGEF1BQ0VAM2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASGEF1BQ0VAM2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RASGEF1BQ0VAM2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RASGEF1BQ0VAM2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RASGEF1BQ0VAM2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RASGEF1BQ0VAM2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RASGEF1BQ0VAM2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RASGEF1BQ0VAM2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RASGEF1BQ0VAM2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RASGEF1BQ0VAM2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RASGEF1BQ0VAM2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RASGEF1BQ0VAM2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RASGEF1BQ0VAM2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RASGEF1BQ0VAM2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RASGEF1BQ0VAM2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RASGEF1BQ0VAM2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RASGEF1BQ0VAM2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RASGEF1BQ0VAM2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RASGEF1BQ0VAM2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RASGEF1BQ0VAM2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RASGEF1BQ0VAM2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RASGEF1BQ0VAM2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RASGEF1BQ0VAM2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RASGEF1BQ0VAM2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RASGEF1BQ0VAM2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RASGEF1BQ0VAM2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RASGEF1BQ0VAM2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RASGEF1BQ0VAM2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RASGEF1BQ0VAM2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RASGEF1BQ0VAM2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RASGEF1BQ0VAM2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RASGEF1BQ0VAM2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RASGEF1BQ0VAM2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RASGEF1BQ0VAM2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RASGEF1BQ0VAM2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RASGEF1BQ0VAM2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RASGEF1BQ0VAM2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RASGEF1BQ0VAM2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RASGEF1BQ0VAM2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RASGEF1BQ0VAM2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RASGEF1BQ0VAM2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RASGEF1BQ0VAM2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RASGEF1BQ0VAM2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASGEF1BQ0VAM2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASGEF1BQ0VAM2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASGEF1BQ0VAM2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASGEF1BQ0VAM2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASGEF1BQ0VAM2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASGEF1BQ0VAM2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASGEF1BQ0VAM2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RASGEF1BQ0VAM2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RASGEF1BQ0VAM2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RASGEF1BQ0VAM2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RASGEF1BQ0VAM2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RASGEF1BQ0VAM2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RASGEF1BQ0VAM2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RASGEF1BQ0VAM2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RASGEF1BQ0VAM2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RASGEF1BQ0VAM2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RASGEF1BQ0VAM2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RASGEF1BQ0VAM2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RASGEF1BQ0VAM2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RASGEF1BQ0VAM2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RASGEF1BQ0VAM2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RASGEF1BQ0VAM2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RASGEF1BQ0VAM2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RASGEF1BQ0VAM2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RASGEF1BQ0VAM2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RASGEF1BQ0VAM2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RASGEF1BQ0VAM2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RASGEF1BQ0VAM2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGEF1BQ0VAM2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGEF1BQ0VAM2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGEF1BQ0VAM2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGEF1BQ0VAM2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGEF1BQ0VAM2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGEF1BQ0VAM2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGEF1BQ0VAM2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGEF1BQ0VAM2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RASGEF1BQ0VAM2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RASGEF1BQ0VAM2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RASGEF1BQ0VAM2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RASGEF1BQ0VAM2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RASGEF1BQ0VAM2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RASGEF1BQ0VAM2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RASGEF1BQ0VAM2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RASGEF1BQ0VAM2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RASGEF1BQ0VAM2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RASGEF1BQ0VAM2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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