Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT17Q04695 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT17Q04695 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT17Q04695 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT17Q04695 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT17Q04695 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT17Q04695 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT17Q04695 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT17Q04695 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT17Q04695 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT17Q04695 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT17Q04695 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT17Q04695 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT17Q04695 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT17Q04695 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT17Q04695 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT17Q04695 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT17Q04695 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT17Q04695 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT17Q04695 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT17Q04695 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT17Q04695 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT17Q04695 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT17Q04695 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT17Q04695 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT17Q04695 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT17Q04695 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT17Q04695 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT17Q04695 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT17Q04695 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT17Q04695 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT17Q04695 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT17Q04695 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT17Q04695 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT17Q04695 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT17Q04695 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT17Q04695 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT17Q04695 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT17Q04695 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT17Q04695 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT17Q04695 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT17Q04695 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT17Q04695 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT17Q04695 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT17Q04695 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT17Q04695 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT17Q04695 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT17Q04695 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT17Q04695 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT17Q04695 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT17Q04695 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT17Q04695 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT17Q04695 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT17Q04695 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT17Q04695 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT17Q04695 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT17Q04695 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT17Q04695 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT17Q04695 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT17Q04695 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT17Q04695 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT17Q04695 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT17Q04695 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT17Q04695 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT17Q04695 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT17Q04695 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT17Q04695 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT17Q04695 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT17Q04695 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT17Q04695 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT17Q04695 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KRT17Q04695 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT17Q04695 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT17Q04695 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT17Q04695 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT17Q04695 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT17Q04695 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT17Q04695 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT17Q04695 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT17Q04695 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT17Q04695 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT17Q04695 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT17Q04695 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT17Q04695 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT17Q04695 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT17Q04695 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT17Q04695 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT17Q04695 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT17Q04695 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT17Q04695 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT17Q04695 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT17Q04695 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT17Q04695 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT17Q04695 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT17Q04695 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT17Q04695 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT17Q04695 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT17Q04695 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT17Q04695 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT17Q04695 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms