Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTGER1P34995 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTGER1P34995 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTGER1P34995 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTGER1P34995 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTGER1P34995 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTGER1P34995 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGER1P34995 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGER1P34995 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGER1P34995 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGER1P34995 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGER1P34995 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGER1P34995 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGER1P34995 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGER1P34995 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGER1P34995 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGER1P34995 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGER1P34995 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGER1P34995 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGER1P34995 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGER1P34995 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGER1P34995 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGER1P34995 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGER1P34995 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGER1P34995 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGER1P34995 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGER1P34995 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGER1P34995 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGER1P34995 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGER1P34995 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGER1P34995 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGER1P34995 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGER1P34995 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGER1P34995 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGER1P34995 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGER1P34995 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGER1P34995 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGER1P34995 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGER1P34995 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGER1P34995 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGER1P34995 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGER1P34995 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGER1P34995 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGER1P34995 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGER1P34995 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGER1P34995 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGER1P34995 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGER1P34995 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGER1P34995 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGER1P34995 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGER1P34995 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGER1P34995 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGER1P34995 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGER1P34995 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGER1P34995 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGER1P34995 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGER1P34995 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGER1P34995 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGER1P34995 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGER1P34995 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGER1P34995 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGER1P34995 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGER1P34995 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGER1P34995 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGER1P34995 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGER1P34995 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGER1P34995 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGER1P34995 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGER1P34995 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGER1P34995 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGER1P34995 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTGER1P34995 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTGER1P34995 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGER1P34995 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGER1P34995 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGER1P34995 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGER1P34995 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGER1P34995 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTGER1P34995 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGER1P34995 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGER1P34995 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGER1P34995 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGER1P34995 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGER1P34995 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTGER1P34995 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGER1P34995 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGER1P34995 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGER1P34995 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGER1P34995 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGER1P34995 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGER1P34995 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGER1P34995 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGER1P34995 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGER1P34995 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTGER1P34995 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGER1P34995 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGER1P34995 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTGER1P34995 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER1P34995 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTGER1P34995 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms