Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VAV1P15498 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAV1P15498 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAV1P15498 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VAV1P15498 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAV1P15498 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VAV1P15498 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VAV1P15498 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAV1P15498 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAV1P15498 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAV1P15498 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAV1P15498 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VAV1P15498 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAV1P15498 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAV1P15498 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAV1P15498 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAV1P15498 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAV1P15498 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAV1P15498 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VAV1P15498 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
VAV1P15498 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VAV1P15498 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VAV1P15498 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VAV1P15498 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VAV1P15498 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VAV1P15498 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VAV1P15498 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAV1P15498 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VAV1P15498 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VAV1P15498 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VAV1P15498 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAV1P15498 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAV1P15498 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAV1P15498 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAV1P15498 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VAV1P15498 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAV1P15498 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAV1P15498 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAV1P15498 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAV1P15498 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VAV1P15498 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAV1P15498 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAV1P15498 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAV1P15498 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAV1P15498 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAV1P15498 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VAV1P15498 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAV1P15498 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAV1P15498 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VAV1P15498 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAV1P15498 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAV1P15498 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAV1P15498 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAV1P15498 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VAV1P15498 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAV1P15498 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VAV1P15498 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAV1P15498 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAV1P15498 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAV1P15498 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAV1P15498 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAV1P15498 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAV1P15498 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAV1P15498 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VAV1P15498 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VAV1P15498 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VAV1P15498 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VAV1P15498 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VAV1P15498 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
VAV1P15498 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VAV1P15498 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAV1P15498 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAV1P15498 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAV1P15498 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAV1P15498 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
VAV1P15498 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAV1P15498 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAV1P15498 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAV1P15498 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VAV1P15498 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAV1P15498 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VAV1P15498 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAV1P15498 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAV1P15498 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAV1P15498 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAV1P15498 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAV1P15498 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VAV1P15498 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
VAV1P15498 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAV1P15498 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
VAV1P15498 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VAV1P15498 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAV1P15498 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAV1P15498 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAV1P15498 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAV1P15498 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAV1P15498 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VAV1P15498 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
VAV1P15498 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VAV1P15498 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms