Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRF1P14222 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRF1P14222 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRF1P14222 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRF1P14222 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PRF1P14222 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRF1P14222 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRF1P14222 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRF1P14222 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRF1P14222 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRF1P14222 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRF1P14222 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRF1P14222 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRF1P14222 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PRF1P14222 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRF1P14222 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PRF1P14222 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRF1P14222 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRF1P14222 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PRF1P14222 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRF1P14222 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRF1P14222 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRF1P14222 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRF1P14222 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRF1P14222 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRF1P14222 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRF1P14222 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRF1P14222 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRF1P14222 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRF1P14222 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRF1P14222 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRF1P14222 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRF1P14222 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRF1P14222 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRF1P14222 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRF1P14222 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRF1P14222 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRF1P14222 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRF1P14222 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRF1P14222 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRF1P14222 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRF1P14222 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRF1P14222 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRF1P14222 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRF1P14222 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRF1P14222 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRF1P14222 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRF1P14222 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRF1P14222 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRF1P14222 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PRF1P14222 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRF1P14222 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRF1P14222 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PRF1P14222 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PRF1P14222 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRF1P14222 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRF1P14222 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRF1P14222 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRF1P14222 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRF1P14222 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRF1P14222 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRF1P14222 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRF1P14222 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRF1P14222 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRF1P14222 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRF1P14222 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRF1P14222 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRF1P14222 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRF1P14222 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRF1P14222 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRF1P14222 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRF1P14222 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRF1P14222 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRF1P14222 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRF1P14222 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRF1P14222 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRF1P14222 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRF1P14222 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRF1P14222 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRF1P14222 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRF1P14222 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRF1P14222 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRF1P14222 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRF1P14222 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRF1P14222 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRF1P14222 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRF1P14222 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRF1P14222 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRF1P14222 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRF1P14222 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRF1P14222 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRF1P14222 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRF1P14222 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRF1P14222 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PRF1P14222 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRF1P14222 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRF1P14222 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRF1P14222 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRF1P14222 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRF1P14222 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms