Protein–RNA interactions for Protein: P13056

NR2C1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C1P13056 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR2C1P13056 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR2C1P13056 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR2C1P13056 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR2C1P13056 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR2C1P13056 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR2C1P13056 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR2C1P13056 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR2C1P13056 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR2C1P13056 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR2C1P13056 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR2C1P13056 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR2C1P13056 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR2C1P13056 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR2C1P13056 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR2C1P13056 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR2C1P13056 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NR2C1P13056 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR2C1P13056 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR2C1P13056 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NR2C1P13056 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR2C1P13056 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR2C1P13056 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NR2C1P13056 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR2C1P13056 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms