Protein–RNA interactions for Protein: P0C8F1

PATE4, Prostate and testis expressed protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATE4P0C8F1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PATE4P0C8F1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATE4P0C8F1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATE4P0C8F1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PATE4P0C8F1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PATE4P0C8F1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PATE4P0C8F1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PATE4P0C8F1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PATE4P0C8F1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PATE4P0C8F1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PATE4P0C8F1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PATE4P0C8F1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PATE4P0C8F1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PATE4P0C8F1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PATE4P0C8F1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PATE4P0C8F1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PATE4P0C8F1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PATE4P0C8F1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PATE4P0C8F1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PATE4P0C8F1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PATE4P0C8F1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PATE4P0C8F1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PATE4P0C8F1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PATE4P0C8F1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PATE4P0C8F1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PATE4P0C8F1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PATE4P0C8F1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PATE4P0C8F1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PATE4P0C8F1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PATE4P0C8F1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PATE4P0C8F1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PATE4P0C8F1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PATE4P0C8F1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PATE4P0C8F1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PATE4P0C8F1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PATE4P0C8F1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PATE4P0C8F1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PATE4P0C8F1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PATE4P0C8F1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PATE4P0C8F1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PATE4P0C8F1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PATE4P0C8F1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PATE4P0C8F1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PATE4P0C8F1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PATE4P0C8F1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PATE4P0C8F1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PATE4P0C8F1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PATE4P0C8F1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PATE4P0C8F1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PATE4P0C8F1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PATE4P0C8F1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PATE4P0C8F1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PATE4P0C8F1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PATE4P0C8F1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PATE4P0C8F1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PATE4P0C8F1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PATE4P0C8F1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PATE4P0C8F1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PATE4P0C8F1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PATE4P0C8F1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PATE4P0C8F1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PATE4P0C8F1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PATE4P0C8F1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PATE4P0C8F1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PATE4P0C8F1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PATE4P0C8F1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PATE4P0C8F1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PATE4P0C8F1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PATE4P0C8F1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PATE4P0C8F1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PATE4P0C8F1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PATE4P0C8F1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PATE4P0C8F1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PATE4P0C8F1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PATE4P0C8F1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PATE4P0C8F1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PATE4P0C8F1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PATE4P0C8F1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PATE4P0C8F1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PATE4P0C8F1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PATE4P0C8F1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PATE4P0C8F1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PATE4P0C8F1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PATE4P0C8F1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PATE4P0C8F1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PATE4P0C8F1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PATE4P0C8F1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PATE4P0C8F1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PATE4P0C8F1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PATE4P0C8F1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PATE4P0C8F1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PATE4P0C8F1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PATE4P0C8F1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PATE4P0C8F1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PATE4P0C8F1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PATE4P0C8F1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PATE4P0C8F1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PATE4P0C8F1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PATE4P0C8F1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PATE4P0C8F1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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