Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NPM3O75607 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NPM3O75607 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NPM3O75607 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NPM3O75607 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NPM3O75607 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NPM3O75607 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NPM3O75607 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NPM3O75607 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NPM3O75607 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NPM3O75607 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NPM3O75607 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NPM3O75607 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NPM3O75607 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NPM3O75607 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NPM3O75607 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NPM3O75607 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NPM3O75607 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NPM3O75607 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NPM3O75607 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NPM3O75607 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NPM3O75607 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NPM3O75607 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NPM3O75607 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NPM3O75607 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NPM3O75607 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NPM3O75607 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NPM3O75607 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NPM3O75607 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NPM3O75607 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NPM3O75607 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NPM3O75607 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NPM3O75607 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NPM3O75607 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NPM3O75607 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NPM3O75607 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NPM3O75607 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NPM3O75607 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NPM3O75607 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NPM3O75607 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NPM3O75607 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NPM3O75607 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NPM3O75607 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NPM3O75607 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NPM3O75607 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NPM3O75607 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NPM3O75607 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NPM3O75607 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NPM3O75607 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NPM3O75607 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NPM3O75607 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NPM3O75607 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NPM3O75607 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NPM3O75607 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NPM3O75607 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NPM3O75607 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NPM3O75607 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NPM3O75607 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NPM3O75607 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
NPM3O75607 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NPM3O75607 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NPM3O75607 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NPM3O75607 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NPM3O75607 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NPM3O75607 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NPM3O75607 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPM3O75607 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPM3O75607 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPM3O75607 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPM3O75607 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NPM3O75607 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NPM3O75607 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NPM3O75607 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NPM3O75607 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NPM3O75607 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NPM3O75607 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NPM3O75607 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NPM3O75607 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NPM3O75607 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NPM3O75607 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NPM3O75607 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NPM3O75607 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NPM3O75607 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NPM3O75607 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NPM3O75607 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NPM3O75607 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NPM3O75607 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
NPM3O75607 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
NPM3O75607 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NPM3O75607 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPM3O75607 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NPM3O75607 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPM3O75607 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPM3O75607 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NPM3O75607 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPM3O75607 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPM3O75607 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPM3O75607 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPM3O75607 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NPM3O75607 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms