Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC50.08■■■■■ 5.61
ABCC9O60706 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC50.08■■■■■ 5.61
ABCC9O60706 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.07■■■■■ 5.61
ABCC9O60706 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC50.04■■■■■ 5.6
ABCC9O60706 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC50.04■■■■■ 5.6
ABCC9O60706 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.03■■■■■ 5.6
ABCC9O60706 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC50.03■■■■■ 5.6
ABCC9O60706 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.02■■■■■ 5.6
ABCC9O60706 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.02■■■■■ 5.6
ABCC9O60706 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC50.02■■■■■ 5.6
ABCC9O60706 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC50.02■■■■■ 5.6
ABCC9O60706 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.02■■■■■ 5.6
ABCC9O60706 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.01■■■■■ 5.6
ABCC9O60706 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.01■■■■■ 5.6
ABCC9O60706 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC50■■■■■ 5.6
ABCC9O60706 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC49.99■■■■■ 5.59
ABCC9O60706 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC49.99■■■■■ 5.59
ABCC9O60706 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.98■■■■■ 5.59
ABCC9O60706 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.98■■■■■ 5.59
ABCC9O60706 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC49.98■■■■■ 5.59
ABCC9O60706 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC49.97■■■■■ 5.59
ABCC9O60706 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC49.97■■■■■ 5.59
ABCC9O60706 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC49.97■■■■■ 5.59
ABCC9O60706 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.96■■■■■ 5.59
ABCC9O60706 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.96■■■■■ 5.59
ABCC9O60706 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.96■■■■■ 5.59
ABCC9O60706 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.96■■■■■ 5.59
ABCC9O60706 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC49.95■■■■■ 5.59
ABCC9O60706 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.95■■■■■ 5.59
ABCC9O60706 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC49.95■■■■■ 5.59
ABCC9O60706 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC49.95■■■■■ 5.59
ABCC9O60706 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.93■■■■■ 5.58
ABCC9O60706 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.92■■■■■ 5.58
ABCC9O60706 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC49.92■■■■■ 5.58
ABCC9O60706 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC49.92■■■■■ 5.58
ABCC9O60706 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC49.92■■■■■ 5.58
ABCC9O60706 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC49.9■■■■■ 5.58
ABCC9O60706 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC49.89■■■■■ 5.58
ABCC9O60706 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.89■■■■■ 5.58
ABCC9O60706 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.88■■■■■ 5.58
ABCC9O60706 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC49.88■■■■■ 5.58
ABCC9O60706 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.88■■■■■ 5.58
ABCC9O60706 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC49.88■■■■■ 5.58
ABCC9O60706 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC49.88■■■■■ 5.58
ABCC9O60706 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC49.88■■■■■ 5.58
ABCC9O60706 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.87■■■■■ 5.57
ABCC9O60706 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC49.87■■■■■ 5.57
ABCC9O60706 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.87■■■■■ 5.57
ABCC9O60706 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC49.87■■■■■ 5.57
ABCC9O60706 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.86■■■■■ 5.57
ABCC9O60706 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.86■■■■■ 5.57
ABCC9O60706 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC49.85■■■■■ 5.57
ABCC9O60706 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC49.85■■■■■ 5.57
ABCC9O60706 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC49.85■■■■■ 5.57
ABCC9O60706 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC49.85■■■■■ 5.57
ABCC9O60706 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC49.85■■■■■ 5.57
ABCC9O60706 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC49.84■■■■■ 5.57
ABCC9O60706 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.83■■■■■ 5.57
ABCC9O60706 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC49.83■■■■■ 5.57
ABCC9O60706 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC49.83■■■■■ 5.57
ABCC9O60706 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.82■■■■■ 5.57
ABCC9O60706 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.82■■■■■ 5.57
ABCC9O60706 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.8■■■■■ 5.56
ABCC9O60706 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC49.8■■■■■ 5.56
ABCC9O60706 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC49.8■■■■■ 5.56
ABCC9O60706 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC49.8■■■■■ 5.56
ABCC9O60706 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC49.79■■■■■ 5.56
ABCC9O60706 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC49.79■■■■■ 5.56
ABCC9O60706 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC49.78■■■■■ 5.56
ABCC9O60706 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.78■■■■■ 5.56
ABCC9O60706 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.77■■■■■ 5.56
ABCC9O60706 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC49.77■■■■■ 5.56
ABCC9O60706 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC49.77■■■■■ 5.56
ABCC9O60706 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC49.77■■■■■ 5.56
ABCC9O60706 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC49.76■■■■■ 5.56
ABCC9O60706 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.75■■■■■ 5.56
ABCC9O60706 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.75■■■■■ 5.55
ABCC9O60706 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC49.75■■■■■ 5.55
ABCC9O60706 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.74■■■■■ 5.55
ABCC9O60706 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.74■■■■■ 5.55
ABCC9O60706 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.72■■■■■ 5.55
ABCC9O60706 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC49.72■■■■■ 5.55
ABCC9O60706 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC49.72■■■■■ 5.55
ABCC9O60706 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.71■■■■■ 5.55
ABCC9O60706 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC49.71■■■■■ 5.55
ABCC9O60706 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.71■■■■■ 5.55
ABCC9O60706 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.7■■■■■ 5.55
ABCC9O60706 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC49.7■■■■■ 5.55
ABCC9O60706 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC49.7■■■■■ 5.55
ABCC9O60706 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC49.7■■■■■ 5.55
ABCC9O60706 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.7■■■■■ 5.55
ABCC9O60706 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC49.69■■■■■ 5.54
ABCC9O60706 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.69■■■■■ 5.54
ABCC9O60706 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC49.69■■■■■ 5.54
ABCC9O60706 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.69■■■■■ 5.54
ABCC9O60706 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.68■■■■■ 5.54
ABCC9O60706 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC49.68■■■■■ 5.54
ABCC9O60706 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.67■■■■■ 5.54
ABCC9O60706 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC49.66■■■■■ 5.54
ABCC9O60706 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC49.66■■■■■ 5.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms