Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
H7C1W4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
H7C1W4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
H7C1W4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
H7C1W4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
H7C1W4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
H7C1W4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
H7C1W4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
H7C1W4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
H7C1W4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
H7C1W4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
H7C1W4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.49
H7C1W4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
H7C1W4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
H7C1W4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
H7C1W4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
H7C1W4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
H7C1W4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
H7C1W4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
H7C1W4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
H7C1W4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
H7C1W4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
H7C1W4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
H7C1W4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
H7C1W4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
H7C1W4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
H7C1W4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
H7C1W4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
H7C1W4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
H7C1W4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
H7C1W4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
H7C1W4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
H7C1W4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
H7C1W4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
H7C1W4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
H7C1W4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
H7C1W4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
H7C1W4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
H7C1W4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
H7C1W4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
H7C1W4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
H7C1W4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
H7C1W4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
H7C1W4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
H7C1W4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
H7C1W4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
H7C1W4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
H7C1W4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
H7C1W4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
H7C1W4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
H7C1W4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
H7C1W4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
H7C1W4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
H7C1W4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
H7C1W4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
H7C1W4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
H7C1W4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
H7C1W4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
H7C1W4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
H7C1W4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
H7C1W4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
H7C1W4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
H7C1W4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
H7C1W4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
H7C1W4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
H7C1W4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
H7C1W4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
H7C1W4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
H7C1W4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
H7C1W4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
H7C1W4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
H7C1W4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
H7C1W4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
H7C1W4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
H7C1W4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
H7C1W4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
H7C1W4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
H7C1W4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
H7C1W4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
H7C1W4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
H7C1W4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
H7C1W4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
H7C1W4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
H7C1W4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
H7C1W4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
H7C1W4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
H7C1W4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
H7C1W4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
H7C1W4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
H7C1W4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
H7C1W4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
H7C1W4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
H7C1W4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
H7C1W4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
H7C1W4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
H7C1W4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
H7C1W4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
H7C1W4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
H7C1W4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
H7C1W4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms