Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALM2-AKAP2B1ALY0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PALM2-AKAP2B1ALY0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALM2-AKAP2B1ALY0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALM2-AKAP2B1ALY0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALM2-AKAP2B1ALY0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PALM2-AKAP2B1ALY0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PALM2-AKAP2B1ALY0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PALM2-AKAP2B1ALY0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PALM2-AKAP2B1ALY0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PALM2-AKAP2B1ALY0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PALM2-AKAP2B1ALY0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PALM2-AKAP2B1ALY0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PALM2-AKAP2B1ALY0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PALM2-AKAP2B1ALY0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PALM2-AKAP2B1ALY0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PALM2-AKAP2B1ALY0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PALM2-AKAP2B1ALY0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PALM2-AKAP2B1ALY0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PALM2-AKAP2B1ALY0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PALM2-AKAP2B1ALY0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PALM2-AKAP2B1ALY0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PALM2-AKAP2B1ALY0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms