Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.159e-7■□□□□ 10.2
TARDBPQ13148 WDR1-216ENST00000514319 719 ntTSL 513.9□□□□□ -0.189e-7■□□□□ 10.2
TARDBPQ13148 WDR1-211ENST00000508079 812 ntTSL 312.42□□□□□ -0.429e-7■□□□□ 10.2
TARDBPQ13148 WDR1-204ENST00000499869 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.659e-7■□□□□ 10.2
TARDBPQ13148 WDR1-217ENST00000515018 274 ntTSL 38.16□□□□□ -1.19e-7■□□□□ 10.2
TARDBPQ13148 WDR1-201ENST00000264785 549 ntTSL 47.45□□□□□ -1.229e-7■□□□□ 10.2
TARDBPQ13148 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.795e-10■□□□□ 10.2
TARDBPQ13148 SSU72-203ENST00000378725 619 ntTSL 218.22■□□□□ 0.515e-10■□□□□ 10.2
TARDBPQ13148 SUN1-213ENST00000433212 3474 ntTSL 511.19□□□□□ -0.622e-8■□□□□ 10.2
TARDBPQ13148 SSU72-202ENST00000359060 4176 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.695e-10■□□□□ 10.2
TARDBPQ13148 ZC3H4-205ENST00000601973 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 514.77□□□□□ -0.054e-6■□□□□ 10.1
TARDBPQ13148 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.184e-6■□□□□ 10.1
TARDBPQ13148 ZC3H4-202ENST00000594019 3259 ntTSL 210.68□□□□□ -0.74e-6■□□□□ 10.1
TARDBPQ13148 NUP214-226ENST00000531600 1775 ntTSL 211.44□□□□□ -0.587e-9■□□□□ 10.1
TARDBPQ13148 NUP214-205ENST00000465486 1068 ntTSL 1 (best)8.47□□□□□ -1.057e-9■□□□□ 10.1
TARDBPQ13148 NUP214-206ENST00000470765 620 ntTSL 58.47□□□□□ -1.057e-9■□□□□ 10.1
TARDBPQ13148 NUP214-218ENST00000528114 575 ntTSL 47.44□□□□□ -1.227e-9■□□□□ 10.1
TARDBPQ13148 NUP214-208ENST00000483497 3275 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.237e-9■□□□□ 10.1
TARDBPQ13148 NUP214-213ENST00000525384 840 ntTSL 1 (best)6.69□□□□□ -1.347e-9■□□□□ 10.1
TARDBPQ13148 SIRT7-210ENST00000572902 909 ntTSL 321.02■□□□□ 0.961e-7■□□□□ 10.1
TARDBPQ13148 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.531e-7■□□□□ 10.1
TARDBPQ13148 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.151e-7■□□□□ 10.1
TARDBPQ13148 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.081e-7■□□□□ 10.1
TARDBPQ13148 PSAP-204ENST00000495196 344 ntTSL 212.55□□□□□ -0.41e-7■□□□□ 10.1
TARDBPQ13148 SHTN1-207ENST00000615301 6730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.851e-7■□□□□ 10.1
TARDBPQ13148 CHPT1-203ENST00000546873 624 ntTSL 36.98□□□□□ -1.291e-7■□□□□ 10.1
TARDBPQ13148 XIST-202ENST00000417942 724 ntTSL 36.46□□□□□ -1.381e-7■□□□□ 10.1
TARDBPQ13148 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.41e-7■□□□□ 10.1
TARDBPQ13148 XIST-203ENST00000421322 446 ntTSL 23.59□□□□□ -1.831e-7■□□□□ 10.1
TARDBPQ13148 SHTN1-206ENST00000497044 3647 ntTSL 23.1□□□□□ -1.911e-7■□□□□ 10.1
TARDBPQ13148 NCL-209ENST00000484328 369 ntTSL 26.13□□□□□ -1.435e-21■□□□□ 10.1
TARDBPQ13148 EXOSC10-207ENST00000474216 2007 ntTSL 214.12□□□□□ -0.151e-6■□□□□ 10
TARDBPQ13148 EXOSC10-206ENST00000472078 412 ntTSL 35.51□□□□□ -1.531e-6■□□□□ 10
TARDBPQ13148 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.352e-6■□□□□ 10
TARDBPQ13148 CDCA5-205ENST00000524733 835 ntTSL 317.5■□□□□ 0.392e-6■□□□□ 10
TARDBPQ13148 CDCA5-208ENST00000529290 789 ntTSL 517.01■□□□□ 0.312e-6■□□□□ 10
TARDBPQ13148 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.052e-6■□□□□ 10
TARDBPQ13148 CDCA5-210ENST00000533015 563 ntTSL 211.64□□□□□ -0.552e-6■□□□□ 10
TARDBPQ13148 CDCA5-206ENST00000525464 672 ntTSL 59.52□□□□□ -0.892e-6■□□□□ 10
TARDBPQ13148 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.324e-7■□□□□ 10
TARDBPQ13148 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.134e-7■□□□□ 10
TARDBPQ13148 RCCD1-208ENST00000557266 2110 ntTSL 1 (best)21.35■■□□□ 1.014e-7■□□□□ 10
TARDBPQ13148 RCCD1-205ENST00000556333 735 ntTSL 1 (best)19.71■□□□□ 0.754e-7■□□□□ 10
TARDBPQ13148 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.554e-7■□□□□ 10
TARDBPQ13148 RCCD1-204ENST00000555737 3157 ntTSL 1 (best)16.98■□□□□ 0.314e-7■□□□□ 10
TARDBPQ13148 RCCD1-207ENST00000556774 139 ntTSL 316.31■□□□□ 0.24e-7■□□□□ 10
TARDBPQ13148 RCCD1-209ENST00000557750 1696 ntTSL 311.9□□□□□ -0.54e-7■□□□□ 10
TARDBPQ13148 NUP85-215ENST00000580879 583 ntTSL 313.14□□□□□ -0.311e-7■□□□□ 10
TARDBPQ13148 NUP85-220ENST00000583070 907 ntTSL 510.4□□□□□ -0.741e-7■□□□□ 10
TARDBPQ13148 NUP85-206ENST00000577645 869 ntTSL 39.6□□□□□ -0.871e-7■□□□□ 10
TARDBPQ13148 NUP85-203ENST00000540768 1926 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.921e-7■□□□□ 10
TARDBPQ13148 NUP85-212ENST00000579557 817 ntTSL 59.3□□□□□ -0.921e-7■□□□□ 10
TARDBPQ13148 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.976e-7■□□□□ 10
TARDBPQ13148 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.966e-7■□□□□ 10
TARDBPQ13148 SLC25A13-203ENST00000472162 568 ntTSL 416.99■□□□□ 0.316e-7■□□□□ 10
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TARDBPQ13148 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.157e-7■□□□□ 10
TARDBPQ13148 PPP1CB-201ENST00000296122 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.447e-7■□□□□ 10
TARDBPQ13148 SLC25A13-202ENST00000416240 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.446e-7■□□□□ 10
TARDBPQ13148 FANCA-210ENST00000563318 605 ntTSL 512.13□□□□□ -0.476e-7■□□□□ 10
TARDBPQ13148 EIF1AD-204ENST00000526451 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.836e-7■□□□□ 10
TARDBPQ13148 EIF1AD-201ENST00000312234 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.976e-7■□□□□ 10
TARDBPQ13148 SLC25A13-201ENST00000265631 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.026e-7■□□□□ 10
TARDBPQ13148 ANKRD17-208ENST00000559367 539 ntTSL 57.53□□□□□ -1.26e-7■□□□□ 10
TARDBPQ13148 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.346e-7■□□□□ 10
TARDBPQ13148 NIPSNAP2-211ENST00000497279 4255 ntTSL 24.59□□□□□ -1.676e-7■□□□□ 10
TARDBPQ13148 SPDYA-205ENST00000462832 2081 ntTSL 24.23□□□□□ -1.737e-7■□□□□ 10
TARDBPQ13148 ZEB2-239ENST00000637045 9091 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.652e-9■□□□□ 10
TARDBPQ13148 GCN1-201ENST00000300648 8675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.649e-7■□□□□ 9.9
TARDBPQ13148 NAMPT-201ENST00000222553 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.643e-9■□□□□ 9.9
TARDBPQ13148 PIK3CB-202ENST00000461451 667 ntTSL 224.18■■□□□ 1.464e-7■□□□□ 9.9
TARDBPQ13148 PIK3CB-210ENST00000483968 721 ntTSL 322.78■■□□□ 1.244e-7■□□□□ 9.9
TARDBPQ13148 ADAMTSL4-206ENST00000489159 1803 ntTSL 216.47■□□□□ 0.231e-9■□□□□ 9.9
TARDBPQ13148 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.241e-9■□□□□ 9.9
TARDBPQ13148 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.281e-9■□□□□ 9.9
TARDBPQ13148 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.411e-9■□□□□ 9.9
TARDBPQ13148 SREK1-207ENST00000520058 559 ntTSL 218.18■□□□□ 0.53e-6■□□□□ 9.9
TARDBPQ13148 SREK1-214ENST00000523851 458 ntTSL 316.61■□□□□ 0.253e-6■□□□□ 9.9
TARDBPQ13148 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.223e-6■□□□□ 9.9
TARDBPQ13148 SREK1-212ENST00000522912 2047 ntTSL 1 (best)15.67■□□□□ 0.13e-6■□□□□ 9.9
TARDBPQ13148 SREK1-209ENST00000520953 2172 ntTSL 514.11□□□□□ -0.153e-6■□□□□ 9.9
TARDBPQ13148 SREK1-215ENST00000524111 4074 ntTSL 58.33□□□□□ -1.083e-6■□□□□ 9.9
TARDBPQ13148 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.43e-6■□□□□ 9.9
TARDBPQ13148 SREK1-210ENST00000521691 580 ntTSL 33.85□□□□□ -1.793e-6■□□□□ 9.9
TARDBPQ13148 PI4KAP2-207ENST00000476537 276 ntTSL 227.36■■□□□ 1.972e-7■□□□□ 9.9
TARDBPQ13148 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.632e-7■□□□□ 9.9
TARDBPQ13148 PI4KAP2-209ENST00000479693 1906 ntTSL 1 (best)24.78■■□□□ 1.562e-7■□□□□ 9.9
TARDBPQ13148 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.852e-7■□□□□ 9.9
TARDBPQ13148 SORT1-203ENST00000471996 469 ntTSL 319.99■□□□□ 0.792e-7■□□□□ 9.9
TARDBPQ13148 PI4KAP2-212ENST00000491562 209 ntTSL 518.28■□□□□ 0.522e-7■□□□□ 9.9
TARDBPQ13148 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.452e-7■□□□□ 9.9
TARDBPQ13148 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.432e-7■□□□□ 9.9
TARDBPQ13148 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.232e-7■□□□□ 9.9
TARDBPQ13148 PI4KAP2-205ENST00000467443 1869 ntTSL 216.18■□□□□ 0.182e-7■□□□□ 9.9
TARDBPQ13148 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.012e-7■□□□□ 9.9
TARDBPQ13148 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.112e-7■□□□□ 9.9
TARDBPQ13148 TRA2B-206ENST00000456380 1697 ntTSL 512.8□□□□□ -0.362e-7■□□□□ 9.9
TARDBPQ13148 TRA2B-208ENST00000465245 634 ntTSL 312.58□□□□□ -0.42e-7■□□□□ 9.9
TARDBPQ13148 TRA2B-212ENST00000480461 538 ntTSL 1 (best)11.82□□□□□ -0.522e-7■□□□□ 9.9
TARDBPQ13148 TRA2B-213ENST00000485530 839 ntTSL 211.82□□□□□ -0.522e-7■□□□□ 9.9
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