Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NFKBIAP25963 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms