Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPBP07199 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPBP07199 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPBP07199 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPBP07199 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPBP07199 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPBP07199 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPBP07199 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPBP07199 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPBP07199 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPBP07199 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPBP07199 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPBP07199 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPBP07199 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPBP07199 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPBP07199 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPBP07199 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPBP07199 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPBP07199 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPBP07199 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPBP07199 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPBP07199 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPBP07199 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPBP07199 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPBP07199 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPBP07199 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPBP07199 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPBP07199 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPBP07199 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPBP07199 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPBP07199 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPBP07199 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPBP07199 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPBP07199 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPBP07199 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPBP07199 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPBP07199 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPBP07199 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPBP07199 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPBP07199 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPBP07199 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPBP07199 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPBP07199 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPBP07199 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPBP07199 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPBP07199 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPBP07199 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPBP07199 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPBP07199 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPBP07199 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPBP07199 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPBP07199 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPBP07199 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPBP07199 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPBP07199 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPBP07199 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPBP07199 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPBP07199 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPBP07199 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPBP07199 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPBP07199 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPBP07199 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPBP07199 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPBP07199 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPBP07199 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPBP07199 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPBP07199 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPBP07199 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPBP07199 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPBP07199 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPBP07199 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPBP07199 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPBP07199 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPBP07199 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPBP07199 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPBP07199 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPBP07199 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPBP07199 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPBP07199 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPBP07199 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPBP07199 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPBP07199 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPBP07199 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPBP07199 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPBP07199 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPBP07199 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPBP07199 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPBP07199 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPBP07199 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPBP07199 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPBP07199 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CENPBP07199 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CENPBP07199 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CENPBP07199 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CENPBP07199 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CENPBP07199 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CENPBP07199 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CENPBP07199 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CENPBP07199 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPBP07199 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms