RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262233.10

EML1-201, Transcript of echinoderm microtubule associated protein like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EML1, Length 4,535 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EML1-201ENST00000262233 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.99■■□□□ 1.91
EML1-201ENST00000262233 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
EML1-201ENST00000262233 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.45■■□□□ 1.66
EML1-201ENST00000262233 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.44■■□□□ 1.66
EML1-201ENST00000262233 HRCP23327 699 aa25.39■■□□□ 1.66
EML1-201ENST00000262233 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
EML1-201ENST00000262233 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
EML1-201ENST00000262233 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.84■■□□□ 1.57
EML1-201ENST00000262233 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.42■■□□□ 1.5
EML1-201ENST00000262233 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
EML1-201ENST00000262233 MYT1Q01538 1121 aa24.35■■□□□ 1.49
EML1-201ENST00000262233 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.28■■□□□ 1.48
EML1-201ENST00000262233 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
EML1-201ENST00000262233 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.23■■□□□ 1.47
EML1-201ENST00000262233 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
EML1-201ENST00000262233 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
EML1-201ENST00000262233 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
EML1-201ENST00000262233 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.87■■□□□ 1.41
EML1-201ENST00000262233 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
EML1-201ENST00000262233 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.74■■□□□ 1.39
EML1-201ENST00000262233 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
EML1-201ENST00000262233 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
EML1-201ENST00000262233 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
EML1-201ENST00000262233 TRIM41Q8WV44 630 aa23.62■■□□□ 1.37
EML1-201ENST00000262233 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.58■■□□□ 1.37
EML1-201ENST00000262233 NEUROD1Q13562 356 aa23.51■■□□□ 1.35
EML1-201ENST00000262233 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
EML1-201ENST00000262233 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
EML1-201ENST00000262233 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.09■■□□□ 1.29
EML1-201ENST00000262233 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
EML1-201ENST00000262233 APLP2Q06481 763 aa22.8■■□□□ 1.24
EML1-201ENST00000262233 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
EML1-201ENST00000262233 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
EML1-201ENST00000262233 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
EML1-201ENST00000262233 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.73■■□□□ 1.23
EML1-201ENST00000262233 MIER1Q8N108 512 aa22.64■■□□□ 1.22
EML1-201ENST00000262233 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
EML1-201ENST00000262233 BCANQ96GW7 911 aa22.6■■□□□ 1.21
EML1-201ENST00000262233 NEFLP07196 543 aa22.6■■□□□ 1.21
EML1-201ENST00000262233 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.44■■□□□ 1.18
EML1-201ENST00000262233 BCL11AQ9H165 835 aa22.44■■□□□ 1.18
EML1-201ENST00000262233 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.27■■□□□ 1.16
EML1-201ENST00000262233 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
EML1-201ENST00000262233 FKBP8Q14318 412 aa22.18■■□□□ 1.14
EML1-201ENST00000262233 ITGAEP38570 1179 aa22.14■■□□□ 1.13
EML1-201ENST00000262233 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.12■■□□□ 1.13
EML1-201ENST00000262233 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.09■■□□□ 1.13
EML1-201ENST00000262233 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
EML1-201ENST00000262233 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
EML1-201ENST00000262233 CEP162Q5TB80 1403 aa21.86■■□□□ 1.09
EML1-201ENST00000262233 ABCC9O60706 1549 aa21.85■■□□□ 1.09
EML1-201ENST00000262233 TRIM52Q96A61 297 aa21.82■■□□□ 1.08
EML1-201ENST00000262233 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
EML1-201ENST00000262233 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
EML1-201ENST00000262233 ANP32CO43423 234 aa21.77■■□□□ 1.08
EML1-201ENST00000262233 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
EML1-201ENST00000262233 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
EML1-201ENST00000262233 SCRIBQ14160 1630 aa21.72■■□□□ 1.07
EML1-201ENST00000262233 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.71■■□□□ 1.07
EML1-201ENST00000262233 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
EML1-201ENST00000262233 NBR1Q14596 966 aa21.65■■□□□ 1.06
EML1-201ENST00000262233 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.6■■□□□ 1.05
EML1-201ENST00000262233 KCNH8Q96L42 1107 aa21.58■■□□□ 1.04
EML1-201ENST00000262233 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.58■■□□□ 1.04
EML1-201ENST00000262233 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
EML1-201ENST00000262233 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.54■■□□□ 1.04
EML1-201ENST00000262233 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
EML1-201ENST00000262233 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
EML1-201ENST00000262233 DEKP35659 375 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
EML1-201ENST00000262233 CLIP1P30622 1438 aa21.47■■□□□ 1.03
EML1-201ENST00000262233 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
EML1-201ENST00000262233 SOGA1O94964 1423 aa21.44■■□□□ 1.02
EML1-201ENST00000262233 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
EML1-201ENST00000262233 GOLGA3Q08378 1498 aa21.39■■□□□ 1.01
EML1-201ENST00000262233 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.34■■□□□ 1.01
EML1-201ENST00000262233 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.34■■□□□ 1.01
EML1-201ENST00000262233 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
EML1-201ENST00000262233 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.32■■□□□ 1
EML1-201ENST00000262233 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
EML1-201ENST00000262233 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
EML1-201ENST00000262233 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
EML1-201ENST00000262233 EEA1Q15075 1411 aa21.29■■□□□ 1
EML1-201ENST00000262233 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
EML1-201ENST00000262233 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP21.27■□□□□ 0.99
EML1-201ENST00000262233 ABCC8Q09428 1581 aa21.25■□□□□ 0.99
EML1-201ENST00000262233 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.25■□□□□ 0.99
EML1-201ENST00000262233 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.24■□□□□ 0.99
EML1-201ENST00000262233 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
EML1-201ENST00000262233 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
EML1-201ENST00000262233 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.2■□□□□ 0.98
EML1-201ENST00000262233 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.17■□□□□ 0.98
EML1-201ENST00000262233 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.17■□□□□ 0.98
EML1-201ENST00000262233 MSH5O43196 834 aa21.15■□□□□ 0.98
EML1-201ENST00000262233 TONSLQ96HA7 1378 aa21.14■□□□□ 0.98
EML1-201ENST00000262233 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.14■□□□□ 0.97
EML1-201ENST00000262233 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.14■□□□□ 0.97
EML1-201ENST00000262233 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.14■□□□□ 0.97
EML1-201ENST00000262233 CCER2I3L3R5 266 aa21.13■□□□□ 0.97
EML1-201ENST00000262233 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.11■□□□□ 0.97
EML1-201ENST00000262233 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms