RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHQ1-201ENST00000325599 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.7■■□□□ 1.87
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SHQ1-201ENST00000325599 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.57■■□□□ 1.68
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SHQ1-201ENST00000325599 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.48■■□□□ 1.67
SHQ1-201ENST00000325599 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.47■■□□□ 1.67
SHQ1-201ENST00000325599 CEP162Q5TB80 1403 aa25.45■■□□□ 1.66
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SHQ1-201ENST00000325599 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.39■■□□□ 1.66
SHQ1-201ENST00000325599 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
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SHQ1-201ENST00000325599 CUX1P39880 1505 aa24.86■■□□□ 1.57
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SHQ1-201ENST00000325599 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.71■■□□□ 1.55
SHQ1-201ENST00000325599 KIF27Q86VH2 1401 aa24.68■■□□□ 1.54
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SHQ1-201ENST00000325599 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
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SHQ1-201ENST00000325599 NESP48681 1621 aa24.26■■□□□ 1.47
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SHQ1-201ENST00000325599 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.18■■□□□ 1.46
SHQ1-201ENST00000325599 P3H3Q8IVL6 736 aa24.18■■□□□ 1.46
SHQ1-201ENST00000325599 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.17■■□□□ 1.46
SHQ1-201ENST00000325599 TOPBP1Q92547 1522 aa24.16■■□□□ 1.46
SHQ1-201ENST00000325599 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
SHQ1-201ENST00000325599 TIAM1Q13009 1591 aa24.13■■□□□ 1.45
SHQ1-201ENST00000325599 MIER1Q8N108 512 aa24.11■■□□□ 1.45
SHQ1-201ENST00000325599 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.1■■□□□ 1.45
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