Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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CASQ1P31415 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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CASQ1P31415 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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CASQ1P31415 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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CASQ1P31415 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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CASQ1P31415 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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CASQ1P31415 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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CASQ1P31415 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
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