RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404287.2

MESTP1-201, Transcript of mesoderm specific transcript pseudogene 1, humanhuman

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Gene MESTP1, Length 994 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESTP1-201ENST00000404287 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.1■■■■■ 5.13
MESTP1-201ENST00000404287 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.8■■■■■ 4.28
MESTP1-201ENST00000404287 ABCC9O60706 1549 aa40.93■■■■■ 4.14
MESTP1-201ENST00000404287 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.32■■■■□ 3.88
MESTP1-201ENST00000404287 NACADO15069 1562 aa39.31■■■■□ 3.88
MESTP1-201ENST00000404287 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.27■■■■□ 3.88
MESTP1-201ENST00000404287 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.19■■■■□ 3.86
MESTP1-201ENST00000404287 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.14■■■■□ 3.86
MESTP1-201ENST00000404287 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.98■■■■□ 3.83
MESTP1-201ENST00000404287 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.48■■■■□ 3.75
MESTP1-201ENST00000404287 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.27■■■■□ 3.72
MESTP1-201ENST00000404287 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.25■■■■□ 3.71
MESTP1-201ENST00000404287 SCRIBQ14160 1630 aa38.16■■■■□ 3.7
MESTP1-201ENST00000404287 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.76■■■■□ 3.63
MESTP1-201ENST00000404287 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.67■■■■□ 3.62
MESTP1-201ENST00000404287 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.19■■■■□ 3.54
MESTP1-201ENST00000404287 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.02■■■■□ 3.52
MESTP1-201ENST00000404287 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.75■■■■□ 3.47
MESTP1-201ENST00000404287 SMARCA4P51532 1647 aa36.52■■■■□ 3.44
MESTP1-201ENST00000404287 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
MESTP1-201ENST00000404287 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.36■■■■□ 3.41
MESTP1-201ENST00000404287 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.33■■■■□ 3.41
MESTP1-201ENST00000404287 NCAPD3P42695 1498 aa36.33■■■■□ 3.41
MESTP1-201ENST00000404287 SMARCA2P51531 1590 aa36.23■■■■□ 3.39
MESTP1-201ENST00000404287 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.21■■■■□ 3.39
MESTP1-201ENST00000404287 HMGXB3Q12766 1538 aa36.13■■■■□ 3.37
MESTP1-201ENST00000404287 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
MESTP1-201ENST00000404287 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
MESTP1-201ENST00000404287 WIZO95785 1651 aa35.9■■■■□ 3.34
MESTP1-201ENST00000404287 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
MESTP1-201ENST00000404287 NESP48681 1621 aa35.46■■■■□ 3.27
MESTP1-201ENST00000404287 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.3■■■■□ 3.24
MESTP1-201ENST00000404287 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.24■■■■□ 3.23
MESTP1-201ENST00000404287 ERCC6Q03468 1493 aa35.17■■■■□ 3.22
MESTP1-201ENST00000404287 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.12■■■■□ 3.21
MESTP1-201ENST00000404287 CFTRP13569 1480 aa35.07■■■■□ 3.2
MESTP1-201ENST00000404287 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.04■■■■□ 3.2
MESTP1-201ENST00000404287 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.98■■■■□ 3.19
MESTP1-201ENST00000404287 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.91■■■■□ 3.18
MESTP1-201ENST00000404287 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.9■■■■□ 3.18
MESTP1-201ENST00000404287 CUX2O14529 1486 aa34.86■■■■□ 3.17
MESTP1-201ENST00000404287 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.83■■■■□ 3.17
MESTP1-201ENST00000404287 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.77■■■■□ 3.16
MESTP1-201ENST00000404287 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.75■■■■□ 3.15
MESTP1-201ENST00000404287 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.72■■■■□ 3.15
MESTP1-201ENST00000404287 PRDM2Q13029 1718 aa34.69■■■■□ 3.14
MESTP1-201ENST00000404287 WDR62O43379 1518 aa34.64■■■■□ 3.14
MESTP1-201ENST00000404287 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
MESTP1-201ENST00000404287 TOPBP1Q92547 1522 aa34.3■■■■□ 3.08
MESTP1-201ENST00000404287 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.23■■■■□ 3.07
MESTP1-201ENST00000404287 ABCC8Q09428 1581 aa34.2■■■■□ 3.07
MESTP1-201ENST00000404287 CUX1P39880 1505 aa34.08■■■■□ 3.05
MESTP1-201ENST00000404287 IFT140Q96RY7 1462 aa34.04■■■■□ 3.04
MESTP1-201ENST00000404287 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.01■■■■□ 3.04
MESTP1-201ENST00000404287 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.95■■■■□ 3.03
MESTP1-201ENST00000404287 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.95■■■■□ 3.03
MESTP1-201ENST00000404287 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.92■■■■□ 3.02
MESTP1-201ENST00000404287 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.88■■■■□ 3.01
MESTP1-201ENST00000404287 SOGA1O94964 1423 aa33.83■■■■□ 3.01
MESTP1-201ENST00000404287 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.8■■■■□ 3
MESTP1-201ENST00000404287 SYNJ1O43426 1573 aa33.77■■■■□ 3
MESTP1-201ENST00000404287 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.77■■■■□ 3
MESTP1-201ENST00000404287 TOP2BQ02880 1626 aa33.75■■■□□ 2.99
MESTP1-201ENST00000404287 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.75■■■□□ 2.99
MESTP1-201ENST00000404287 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.74■■■□□ 2.99
MESTP1-201ENST00000404287 WDR97A6NE52 1622 aa33.66■■■□□ 2.98
MESTP1-201ENST00000404287 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.66■■■□□ 2.98
MESTP1-201ENST00000404287 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.6■■■□□ 2.97
MESTP1-201ENST00000404287 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.47■■■□□ 2.95
MESTP1-201ENST00000404287 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.44■■■□□ 2.94
MESTP1-201ENST00000404287 GRIN2BQ13224 1484 aa33.43■■■□□ 2.94
MESTP1-201ENST00000404287 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.4■■■□□ 2.94
MESTP1-201ENST00000404287 OSCARQ8IYS5 282 aa33.38■■■□□ 2.93
MESTP1-201ENST00000404287 PBRM1Q86U86 1689 aa33.35■■■□□ 2.93
MESTP1-201ENST00000404287 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.33■■■□□ 2.93
MESTP1-201ENST00000404287 CHD1O14646 1710 aa33.31■■■□□ 2.92
MESTP1-201ENST00000404287 SYNJ2O15056 1496 aa33.22■■■□□ 2.91
MESTP1-201ENST00000404287 FBLN2P98095 1184 aa33.2■■■□□ 2.91
MESTP1-201ENST00000404287 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.17■■■□□ 2.9
MESTP1-201ENST00000404287 ADAMTS12P58397 1594 aa33.14■■■□□ 2.9
MESTP1-201ENST00000404287 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.13■■■□□ 2.89
MESTP1-201ENST00000404287 TRIM41Q8WV44 630 aa33.08■■■□□ 2.89
MESTP1-201ENST00000404287 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.06■■■□□ 2.88
MESTP1-201ENST00000404287 KIF27Q86VH2 1401 aa33.06■■■□□ 2.88
MESTP1-201ENST00000404287 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.02■■■□□ 2.88
MESTP1-201ENST00000404287 GRIN2AQ12879 1464 aa33.02■■■□□ 2.88
MESTP1-201ENST00000404287 IGF1RP08069 1367 aa33.01■■■□□ 2.88
MESTP1-201ENST00000404287 NUP160Q12769 1436 aa32.92■■■□□ 2.86
MESTP1-201ENST00000404287 ARHGEF11O15085 1522 aa32.91■■■□□ 2.86
MESTP1-201ENST00000404287 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.9■■■□□ 2.86
MESTP1-201ENST00000404287 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.9■■■□□ 2.86
MESTP1-201ENST00000404287 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.9■■■□□ 2.86
MESTP1-201ENST00000404287 CEP170Q5SW79 1584 aa32.89■■■□□ 2.86
MESTP1-201ENST00000404287 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.89■■■□□ 2.86
MESTP1-201ENST00000404287 CUL7Q14999 1698 aa32.82■■■□□ 2.84
MESTP1-201ENST00000404287 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.76■■■□□ 2.83
MESTP1-201ENST00000404287 ARAP1Q96P48 1450 aa32.68■■■□□ 2.82
MESTP1-201ENST00000404287 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.67■■■□□ 2.82
MESTP1-201ENST00000404287 SHROOM2Q13796 1616 aa32.65■■■□□ 2.82
MESTP1-201ENST00000404287 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.61■■■□□ 2.81
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