Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 ZNF420-209ENST00000590332 541 ntTSL 414.98□□□□□ -0.018e-7■■□□□ 12.4
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TARDBPQ13148 GNAS-241ENST00000482112 704 ntTSL 314.83□□□□□ -0.041e-12■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 ZNF420-206ENST00000587082 571 ntTSL 414.78□□□□□ -0.048e-7■■□□□ 12.4
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TARDBPQ13148 ZNF420-205ENST00000587029 612 ntTSL 414.49□□□□□ -0.098e-7■■□□□ 12.4
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TARDBPQ13148 GNAS-222ENST00000464624 3764 ntTSL 513.36□□□□□ -0.271e-12■■□□□ 12.4
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TARDBPQ13148 GNAS-217ENST00000423897 736 ntTSL 311.69□□□□□ -0.541e-12■■□□□ 12.4
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TARDBPQ13148 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.462e-6■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 PCMTD1-204ENST00000519975 995 ntTSL 25.48□□□□□ -1.532e-6■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 RAB3GAP1-204ENST00000487003 3506 ntTSL 55.1□□□□□ -1.592e-6■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 CDK19-206ENST00000463016 604 ntTSL 53.88□□□□□ -1.792e-6■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.973e-7■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.673e-7■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 SCAMP3-208ENST00000490999 1011 ntTSL 216.04■□□□□ 0.163e-7■■□□□ 12.4
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TARDBPQ13148 SCAMP3-206ENST00000478737 649 ntTSL 39.84□□□□□ -0.833e-7■■□□□ 12.4
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TARDBPQ13148 PPP4R3A-211ENST00000557018 534 ntTSL 517.46■□□□□ 0.391e-6■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 PPP4R3A-207ENST00000555029 571 ntTSL 514.52□□□□□ -0.091e-6■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 GFPT1-201ENST00000357308 8703 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.076e-7■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.386e-7■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 ERICH1-211ENST00000524138 682 ntTSL 316.31■□□□□ 0.23e-6■■□□□ 12.4
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TARDBPQ13148 UBE2I-208ENST00000473256 1771 ntTSL 217.74■□□□□ 0.431e-9■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.431e-9■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 UBE2I-216ENST00000567383 538 ntTSL 417.06■□□□□ 0.321e-9■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 UBE2I-218ENST00000568288 501 ntTSL 516.9■□□□□ 0.31e-9■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 UBE2I-217ENST00000568209 266 ntTSL 516.78■□□□□ 0.281e-9■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 UBE2I-210ENST00000562482 735 ntTSL 216.28■□□□□ 0.21e-9■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.051e-9■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.251e-9■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.291e-9■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 ZNF33A-205ENST00000469037 1530 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.388e-8■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.41e-9■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.278e-8■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.498e-8■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.548e-8■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.68e-8■■□□□ 12.4
TARDBPQ13148 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.051e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 TRAP1-207ENST00000571804 781 ntTSL 522.96■■□□□ 1.275e-7■■□□□ 12.3
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