Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6L6

SLCO1B1, Solute carrier organic anion transporter family member 1B1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B1Q9Y6L6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLCO1B1Q9Y6L6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLCO1B1Q9Y6L6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLCO1B1Q9Y6L6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLCO1B1Q9Y6L6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLCO1B1Q9Y6L6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLCO1B1Q9Y6L6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLCO1B1Q9Y6L6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLCO1B1Q9Y6L6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLCO1B1Q9Y6L6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLCO1B1Q9Y6L6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLCO1B1Q9Y6L6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLCO1B1Q9Y6L6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLCO1B1Q9Y6L6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLCO1B1Q9Y6L6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLCO1B1Q9Y6L6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLCO1B1Q9Y6L6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLCO1B1Q9Y6L6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLCO1B1Q9Y6L6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLCO1B1Q9Y6L6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLCO1B1Q9Y6L6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLCO1B1Q9Y6L6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLCO1B1Q9Y6L6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLCO1B1Q9Y6L6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLCO1B1Q9Y6L6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLCO1B1Q9Y6L6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLCO1B1Q9Y6L6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLCO1B1Q9Y6L6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLCO1B1Q9Y6L6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLCO1B1Q9Y6L6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLCO1B1Q9Y6L6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLCO1B1Q9Y6L6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLCO1B1Q9Y6L6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLCO1B1Q9Y6L6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLCO1B1Q9Y6L6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLCO1B1Q9Y6L6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLCO1B1Q9Y6L6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLCO1B1Q9Y6L6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLCO1B1Q9Y6L6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLCO1B1Q9Y6L6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLCO1B1Q9Y6L6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLCO1B1Q9Y6L6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLCO1B1Q9Y6L6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLCO1B1Q9Y6L6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLCO1B1Q9Y6L6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLCO1B1Q9Y6L6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLCO1B1Q9Y6L6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLCO1B1Q9Y6L6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLCO1B1Q9Y6L6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLCO1B1Q9Y6L6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLCO1B1Q9Y6L6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLCO1B1Q9Y6L6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLCO1B1Q9Y6L6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLCO1B1Q9Y6L6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLCO1B1Q9Y6L6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLCO1B1Q9Y6L6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLCO1B1Q9Y6L6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLCO1B1Q9Y6L6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLCO1B1Q9Y6L6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLCO1B1Q9Y6L6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLCO1B1Q9Y6L6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLCO1B1Q9Y6L6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLCO1B1Q9Y6L6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLCO1B1Q9Y6L6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLCO1B1Q9Y6L6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLCO1B1Q9Y6L6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLCO1B1Q9Y6L6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLCO1B1Q9Y6L6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLCO1B1Q9Y6L6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLCO1B1Q9Y6L6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLCO1B1Q9Y6L6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLCO1B1Q9Y6L6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLCO1B1Q9Y6L6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLCO1B1Q9Y6L6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLCO1B1Q9Y6L6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLCO1B1Q9Y6L6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLCO1B1Q9Y6L6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLCO1B1Q9Y6L6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLCO1B1Q9Y6L6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLCO1B1Q9Y6L6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLCO1B1Q9Y6L6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLCO1B1Q9Y6L6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLCO1B1Q9Y6L6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLCO1B1Q9Y6L6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLCO1B1Q9Y6L6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLCO1B1Q9Y6L6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLCO1B1Q9Y6L6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLCO1B1Q9Y6L6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLCO1B1Q9Y6L6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLCO1B1Q9Y6L6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLCO1B1Q9Y6L6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLCO1B1Q9Y6L6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLCO1B1Q9Y6L6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLCO1B1Q9Y6L6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLCO1B1Q9Y6L6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLCO1B1Q9Y6L6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLCO1B1Q9Y6L6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLCO1B1Q9Y6L6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLCO1B1Q9Y6L6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLCO1B1Q9Y6L6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms