Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W3

KLF2, Krueppel-like factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF2Q9Y5W3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLF2Q9Y5W3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLF2Q9Y5W3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLF2Q9Y5W3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLF2Q9Y5W3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLF2Q9Y5W3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLF2Q9Y5W3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLF2Q9Y5W3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLF2Q9Y5W3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLF2Q9Y5W3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLF2Q9Y5W3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLF2Q9Y5W3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLF2Q9Y5W3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLF2Q9Y5W3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLF2Q9Y5W3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLF2Q9Y5W3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLF2Q9Y5W3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLF2Q9Y5W3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KLF2Q9Y5W3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLF2Q9Y5W3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLF2Q9Y5W3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLF2Q9Y5W3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLF2Q9Y5W3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLF2Q9Y5W3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLF2Q9Y5W3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF2Q9Y5W3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF2Q9Y5W3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF2Q9Y5W3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF2Q9Y5W3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF2Q9Y5W3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF2Q9Y5W3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF2Q9Y5W3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF2Q9Y5W3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF2Q9Y5W3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF2Q9Y5W3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF2Q9Y5W3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF2Q9Y5W3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLF2Q9Y5W3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLF2Q9Y5W3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF2Q9Y5W3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF2Q9Y5W3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF2Q9Y5W3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF2Q9Y5W3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KLF2Q9Y5W3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KLF2Q9Y5W3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF2Q9Y5W3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF2Q9Y5W3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF2Q9Y5W3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF2Q9Y5W3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF2Q9Y5W3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF2Q9Y5W3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF2Q9Y5W3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms