Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
VAX2Q9UIW0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAX2Q9UIW0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAX2Q9UIW0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAX2Q9UIW0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAX2Q9UIW0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAX2Q9UIW0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAX2Q9UIW0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAX2Q9UIW0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAX2Q9UIW0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VAX2Q9UIW0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAX2Q9UIW0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAX2Q9UIW0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAX2Q9UIW0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAX2Q9UIW0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAX2Q9UIW0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAX2Q9UIW0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAX2Q9UIW0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAX2Q9UIW0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAX2Q9UIW0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAX2Q9UIW0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
VAX2Q9UIW0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAX2Q9UIW0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAX2Q9UIW0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAX2Q9UIW0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAX2Q9UIW0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAX2Q9UIW0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAX2Q9UIW0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAX2Q9UIW0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAX2Q9UIW0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAX2Q9UIW0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAX2Q9UIW0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAX2Q9UIW0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAX2Q9UIW0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAX2Q9UIW0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAX2Q9UIW0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VAX2Q9UIW0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAX2Q9UIW0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAX2Q9UIW0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAX2Q9UIW0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
VAX2Q9UIW0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
VAX2Q9UIW0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VAX2Q9UIW0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAX2Q9UIW0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAX2Q9UIW0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAX2Q9UIW0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAX2Q9UIW0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAX2Q9UIW0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAX2Q9UIW0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAX2Q9UIW0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAX2Q9UIW0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAX2Q9UIW0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAX2Q9UIW0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAX2Q9UIW0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAX2Q9UIW0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAX2Q9UIW0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAX2Q9UIW0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAX2Q9UIW0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAX2Q9UIW0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAX2Q9UIW0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAX2Q9UIW0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAX2Q9UIW0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAX2Q9UIW0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAX2Q9UIW0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAX2Q9UIW0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAX2Q9UIW0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAX2Q9UIW0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAX2Q9UIW0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAX2Q9UIW0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAX2Q9UIW0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAX2Q9UIW0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms