Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW3

APOBEC3C, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3CQ9NRW3 MVD-209ENST00000565149 2352 ntTSL 1 (best)17.81■□□□□ 0.442e-11■■■□□ 15.4
APOBEC3CQ9NRW3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.361e-6■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.321e-6■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.21e-6■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.131e-6■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 CIZ1-217ENST00000476541 513 ntTSL 320.17■□□□□ 0.822e-12■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.641e-6■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 EMD-207ENST00000486738 1284 ntTSL 318.99■□□□□ 0.634e-17■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.571e-6■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.531e-6■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 758 ntTSL 517.27■□□□□ 0.361e-6■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.211e-6■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 GSE1-205ENST00000412692 6625 ntTSL 514.98□□□□□ -0.011e-6■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.051e-6■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.071e-6■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.141e-6■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 GRK2-202ENST00000416281 4493 ntTSL 214.13□□□□□ -0.151e-6■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.151e-6■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 NEDD8-208ENST00000560427 654 ntTSL 214.09□□□□□ -0.151e-6■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 DDX39B-203ENST00000417023 561 ntTSL 513.98□□□□□ -0.171e-6■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 AC009779.3-201ENST00000551946 1024 ntTSL 213.41□□□□□ -0.261e-6■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.311e-6■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.331e-6■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 NEDD8-MDP1-203ENST00000604306 681 ntTSL 512.81□□□□□ -0.361e-6■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.371e-6■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 AC009779.3-203ENST00000257899 745 ntTSL 512.43□□□□□ -0.421e-6■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 NEDD8-204ENST00000526430 286 ntTSL 312.02□□□□□ -0.491e-6■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 GSE1-207ENST00000469381 5885 ntTSL 211.59□□□□□ -0.551e-6■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 NEDD8-205ENST00000527046 847 ntTSL 211.52□□□□□ -0.571e-6■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.571e-6■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 NEDD8-202ENST00000396828 626 ntTSL 211.35□□□□□ -0.591e-6■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 AC009779.3-202ENST00000550412 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.621e-6■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 BLOC1S1-206ENST00000553100 421 ntTSL 210.55□□□□□ -0.721e-6■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 NEDD8-206ENST00000531430 651 ntTSL 210.29□□□□□ -0.761e-6■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 471 ntTSL 29□□□□□ -0.971e-6■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 NEDD8-203ENST00000524927 653 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.171e-6■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.451e-6■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 CUTA-208ENST00000482684 837 ntTSL 1 (best)21.95■■□□□ 1.12e-7■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.772e-7■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.082e-7■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 CUTA-201ENST00000374484 658 ntTSL 314.94□□□□□ -0.022e-7■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.022e-7■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.132e-7■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 CUTA-206ENST00000465956 961 ntTSL 212.51□□□□□ -0.412e-7■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 CUTA-211ENST00000488478 676 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.582e-7■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 CUTA-205ENST00000462802 1054 ntTSL 1 (best)10.63□□□□□ -0.712e-7■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 CUTA-209ENST00000487637 1378 ntTSL 210.59□□□□□ -0.712e-7■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 CUTA-213ENST00000494751 731 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.762e-7■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 CUTA-214ENST00000607266 661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.82e-7■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 CUTA-207ENST00000479249 562 ntTSL 38.86□□□□□ -0.992e-7■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.381e-7■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.86e-15■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 DDX39B-201ENST00000376177 1529 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.473e-7■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 ATP6V1G2-DDX39B-201ENST00000376185 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.623e-7■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 DDX39B-214ENST00000458640 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.663e-7■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 DDX39B-202ENST00000396172 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.733e-7■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 DDX39B-217ENST00000474961 974 ntTSL 210.06□□□□□ -0.83e-7■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 DDX39B-215ENST00000462256 4027 ntTSL 29.94□□□□□ -0.823e-7■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 DDX39B-216ENST00000462421 618 ntTSL 39.82□□□□□ -0.843e-7■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 DDX39B-221ENST00000484566 857 ntTSL 59.54□□□□□ -0.883e-7■■■□□ 15.3
APOBEC3CQ9NRW3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.513e-8■■■□□ 15.2
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.843e-8■■■□□ 15.2
APOBEC3CQ9NRW3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.785e-7■■■□□ 15.1
APOBEC3CQ9NRW3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.535e-7■■■□□ 15.1
APOBEC3CQ9NRW3 SNRPB-203ENST00000474384 985 ntTSL 519.48■□□□□ 0.713e-10■■■□□ 15.1
APOBEC3CQ9NRW3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.635e-7■■■□□ 15.1
APOBEC3CQ9NRW3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.565e-7■■■□□ 15.1
APOBEC3CQ9NRW3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.373e-10■■■□□ 15.1
APOBEC3CQ9NRW3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.373e-10■■■□□ 15.1
APOBEC3CQ9NRW3 CD63-209ENST00000550050 829 ntTSL 517.22■□□□□ 0.355e-7■■■□□ 15.1
APOBEC3CQ9NRW3 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.255e-7■■■□□ 15.1
APOBEC3CQ9NRW3 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.145e-7■■■□□ 15.1
APOBEC3CQ9NRW3 CD63-212ENST00000552067 621 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.325e-7■■■□□ 15.1
APOBEC3CQ9NRW3 CD63-215ENST00000552754 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.365e-7■■■□□ 15.1
APOBEC3CQ9NRW3 CD63-207ENST00000548898 727 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.385e-7■■■□□ 15.1
APOBEC3CQ9NRW3 CD63-206ENST00000548160 648 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.775e-7■■■□□ 15.1
APOBEC3CQ9NRW3 B2M-213ENST00000623550 2329 nt6.81□□□□□ -1.327e-9■■■□□ 15.1
APOBEC3CQ9NRW3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.016e-8■■■□□ 15.1
APOBEC3CQ9NRW3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.336e-8■■■□□ 15.1
APOBEC3CQ9NRW3 POM121C-207ENST00000614583 4073 ntTSL 213.88□□□□□ -0.196e-8■■■□□ 15.1
APOBEC3CQ9NRW3 AC004148.2-201ENST00000575890 1938 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.116e-8■■■□□ 15.1
APOBEC3CQ9NRW3 PDCD6-205ENST00000507473 486 ntTSL 38□□□□□ -1.136e-8■■■□□ 15.1
APOBEC3CQ9NRW3 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.536e-8■■■□□ 15.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.593e-16■■■□□ 15.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.23e-16■■■□□ 15.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.083e-16■■■□□ 15.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPS9-206ENST00000436445 752 ntTSL 215.54■□□□□ 0.083e-16■■■□□ 15.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPS9-208ENST00000445961 944 ntTSL 515.54■□□□□ 0.083e-16■■■□□ 15.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPS9-209ENST00000448962 2384 ntTSL 215.19■□□□□ 0.023e-16■■■□□ 15.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPS9-211ENST00000484121 897 ntTSL 214.94□□□□□ -0.023e-16■■■□□ 15.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.13e-16■■■□□ 15.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPS9-213ENST00000626547 476 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.23e-16■■■□□ 15.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPS9-212ENST00000495002 956 ntTSL 1 (best)13.4□□□□□ -0.263e-16■■■□□ 15.1
APOBEC3CQ9NRW3 SMG7-212ENST00000507469 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.588e-7■■■□□ 15.1
APOBEC3CQ9NRW3 SMG7-201ENST00000347615 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.818e-7■■■□□ 15.1
APOBEC3CQ9NRW3 SMG7-215ENST00000515829 5629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.828e-7■■■□□ 15.1
APOBEC3CQ9NRW3 SMG7-202ENST00000367537 5970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.058e-7■■■□□ 15.1
APOBEC3CQ9NRW3 SMG7-209ENST00000495321 556 ntTSL 37.54□□□□□ -1.28e-7■■■□□ 15.1
APOBEC3CQ9NRW3 MYL6-205ENST00000546845 452 ntTSL 310.02□□□□□ -0.814e-9■■■□□ 15
APOBEC3CQ9NRW3 MYL6-212ENST00000548725 582 ntTSL 213.58□□□□□ -0.242e-12■■■□□ 15
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