RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476541.1

CIZ1-217, Transcript of CDKN1A interacting zinc finger protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CIZ1, Length 513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1-217ENST00000476541 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.68■■■■■ 4.74
CIZ1-217ENST00000476541 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.63■■■■□ 3.93
CIZ1-217ENST00000476541 ABCC9O60706 1549 aa38■■■■□ 3.67
CIZ1-217ENST00000476541 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.36■■■■□ 3.57
CIZ1-217ENST00000476541 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.1■■■■□ 3.53
CIZ1-217ENST00000476541 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.07■■■■□ 3.53
CIZ1-217ENST00000476541 NACADO15069 1562 aa37.07■■■■□ 3.52
CIZ1-217ENST00000476541 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.97■■■■□ 3.51
CIZ1-217ENST00000476541 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.93■■■■□ 3.5
CIZ1-217ENST00000476541 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.11■■■■□ 3.37
CIZ1-217ENST00000476541 SCRIBQ14160 1630 aa36.04■■■■□ 3.36
CIZ1-217ENST00000476541 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.72■■■■□ 3.31
CIZ1-217ENST00000476541 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.6■■■■□ 3.29
CIZ1-217ENST00000476541 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.51■■■■□ 3.28
CIZ1-217ENST00000476541 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.78■■■■□ 3.16
CIZ1-217ENST00000476541 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.66■■■■□ 3.14
CIZ1-217ENST00000476541 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.64■■■■□ 3.14
CIZ1-217ENST00000476541 SMARCA4P51532 1647 aa34.59■■■■□ 3.13
CIZ1-217ENST00000476541 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.48■■■■□ 3.11
CIZ1-217ENST00000476541 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.38■■■■□ 3.09
CIZ1-217ENST00000476541 SMARCA2P51531 1590 aa34.29■■■■□ 3.08
CIZ1-217ENST00000476541 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.28■■■■□ 3.08
CIZ1-217ENST00000476541 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.22■■■■□ 3.07
CIZ1-217ENST00000476541 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.2■■■■□ 3.07
CIZ1-217ENST00000476541 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.19■■■■□ 3.06
CIZ1-217ENST00000476541 NCAPD3P42695 1498 aa34.13■■■■□ 3.05
CIZ1-217ENST00000476541 HMGXB3Q12766 1538 aa34.09■■■■□ 3.05
CIZ1-217ENST00000476541 WIZO95785 1651 aa34.07■■■■□ 3.04
CIZ1-217ENST00000476541 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.99■■■■□ 3.03
CIZ1-217ENST00000476541 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.81■■■■□ 3
CIZ1-217ENST00000476541 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.65■■■□□ 2.98
CIZ1-217ENST00000476541 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.32■■■□□ 2.92
CIZ1-217ENST00000476541 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.21■■■□□ 2.91
CIZ1-217ENST00000476541 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.14■■■□□ 2.9
CIZ1-217ENST00000476541 CFTRP13569 1480 aa33.08■■■□□ 2.89
CIZ1-217ENST00000476541 PRDM2Q13029 1718 aa33.05■■■□□ 2.88
CIZ1-217ENST00000476541 NESP48681 1621 aa33.02■■■□□ 2.88
CIZ1-217ENST00000476541 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.93■■■□□ 2.86
CIZ1-217ENST00000476541 ERCC6Q03468 1493 aa32.79■■■□□ 2.84
CIZ1-217ENST00000476541 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.78■■■□□ 2.84
CIZ1-217ENST00000476541 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.76■■■□□ 2.84
CIZ1-217ENST00000476541 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.71■■■□□ 2.83
CIZ1-217ENST00000476541 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.54■■■□□ 2.8
CIZ1-217ENST00000476541 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.53■■■□□ 2.8
CIZ1-217ENST00000476541 ABCC8Q09428 1581 aa32.45■■■□□ 2.79
CIZ1-217ENST00000476541 WDR62O43379 1518 aa32.43■■■□□ 2.78
CIZ1-217ENST00000476541 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.37■■■□□ 2.77
CIZ1-217ENST00000476541 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
CIZ1-217ENST00000476541 TOPBP1Q92547 1522 aa32.31■■■□□ 2.76
CIZ1-217ENST00000476541 CUX2O14529 1486 aa32.3■■■□□ 2.76
CIZ1-217ENST00000476541 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.27■■■□□ 2.76
CIZ1-217ENST00000476541 CUX1P39880 1505 aa32.25■■■□□ 2.75
CIZ1-217ENST00000476541 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.22■■■□□ 2.75
CIZ1-217ENST00000476541 TOP2BQ02880 1626 aa32.19■■■□□ 2.74
CIZ1-217ENST00000476541 SYNJ1O43426 1573 aa32.15■■■□□ 2.74
CIZ1-217ENST00000476541 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.06■■■□□ 2.72
CIZ1-217ENST00000476541 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.06■■■□□ 2.72
CIZ1-217ENST00000476541 IFT140Q96RY7 1462 aa32.01■■■□□ 2.71
CIZ1-217ENST00000476541 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.93■■■□□ 2.7
CIZ1-217ENST00000476541 SOGA1O94964 1423 aa31.92■■■□□ 2.7
CIZ1-217ENST00000476541 WDR97A6NE52 1622 aa31.87■■■□□ 2.69
CIZ1-217ENST00000476541 TRIM41Q8WV44 630 aa31.84■■■□□ 2.69
CIZ1-217ENST00000476541 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.84■■■□□ 2.69
CIZ1-217ENST00000476541 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.82■■■□□ 2.68
CIZ1-217ENST00000476541 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.76■■■□□ 2.67
CIZ1-217ENST00000476541 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
CIZ1-217ENST00000476541 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.66
CIZ1-217ENST00000476541 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.67■■■□□ 2.66
CIZ1-217ENST00000476541 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.6■■■□□ 2.65
CIZ1-217ENST00000476541 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.59■■■□□ 2.65
CIZ1-217ENST00000476541 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.59■■■□□ 2.652e-6■■■□□ 18.3
CIZ1-217ENST00000476541 KIF27Q86VH2 1401 aa31.58■■■□□ 2.65
CIZ1-217ENST00000476541 PBRM1Q86U86 1689 aa31.57■■■□□ 2.65
CIZ1-217ENST00000476541 GRIN2BQ13224 1484 aa31.53■■■□□ 2.64
CIZ1-217ENST00000476541 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.49■■■□□ 2.63
CIZ1-217ENST00000476541 EEA1Q15075 1411 aa31.43■■■□□ 2.62
CIZ1-217ENST00000476541 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.43■■■□□ 2.62
CIZ1-217ENST00000476541 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.37■■■□□ 2.61
CIZ1-217ENST00000476541 CUL7Q14999 1698 aa31.36■■■□□ 2.61
CIZ1-217ENST00000476541 ADAMTS12P58397 1594 aa31.32■■■□□ 2.6
CIZ1-217ENST00000476541 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.31■■■□□ 2.6
CIZ1-217ENST00000476541 IGF1RP08069 1367 aa31.3■■■□□ 2.6
CIZ1-217ENST00000476541 SYNJ2O15056 1496 aa31.27■■■□□ 2.6
CIZ1-217ENST00000476541 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.26■■■□□ 2.6
CIZ1-217ENST00000476541 CHD1O14646 1710 aa31.21■■■□□ 2.59
CIZ1-217ENST00000476541 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.16■■■□□ 2.58
CIZ1-217ENST00000476541 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.15■■■□□ 2.58
CIZ1-217ENST00000476541 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.58
CIZ1-217ENST00000476541 GRIN2AQ12879 1464 aa31.12■■■□□ 2.57
CIZ1-217ENST00000476541 PRXQ9BXM0 1461 aa31.08■■■□□ 2.57
CIZ1-217ENST00000476541 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.08■■■□□ 2.57
CIZ1-217ENST00000476541 FBLN2P98095 1184 aa31.08■■■□□ 2.57
CIZ1-217ENST00000476541 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.05■■■□□ 2.56
CIZ1-217ENST00000476541 KIF21BO75037 1637 aa31.04■■■□□ 2.56
CIZ1-217ENST00000476541 OSCARQ8IYS5 282 aa30.97■■■□□ 2.55
CIZ1-217ENST00000476541 NUP160Q12769 1436 aa30.96■■■□□ 2.55
CIZ1-217ENST00000476541 CEP170Q5SW79 1584 aa30.92■■■□□ 2.54
CIZ1-217ENST00000476541 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.87■■■□□ 2.53
CIZ1-217ENST00000476541 GOLGA3Q08378 1498 aa30.86■■■□□ 2.53
CIZ1-217ENST00000476541 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.86■■■□□ 2.53
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