RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484121.5

RPS9-211, Transcript of ribosomal protein S9, humanhuman

TSL 2

Gene RPS9, Length 897 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS9-211ENST00000484121 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.71■■■□□ 2.99
RPS9-211ENST00000484121 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.07■■■□□ 2.4
RPS9-211ENST00000484121 ABCC9O60706 1549 aa30.01■■■□□ 2.39
RPS9-211ENST00000484121 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.59■■■□□ 2.17
RPS9-211ENST00000484121 NACADO15069 1562 aa28.45■■■□□ 2.15
RPS9-211ENST00000484121 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.43■■■□□ 2.14
RPS9-211ENST00000484121 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.13■■■□□ 2.09
RPS9-211ENST00000484121 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.06■■■□□ 2.08
RPS9-211ENST00000484121 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.02■■■□□ 2.08
RPS9-211ENST00000484121 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
RPS9-211ENST00000484121 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.87■■■□□ 2.05
RPS9-211ENST00000484121 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.84■■■□□ 2.05
RPS9-211ENST00000484121 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.77■■■□□ 2.04
RPS9-211ENST00000484121 SCRIBQ14160 1630 aa27.46■■□□□ 1.99
RPS9-211ENST00000484121 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.41■■□□□ 1.98
RPS9-211ENST00000484121 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
RPS9-211ENST00000484121 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.08■■□□□ 1.93
RPS9-211ENST00000484121 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.01■■□□□ 1.91
RPS9-211ENST00000484121 NCAPD3P42695 1498 aa26.31■■□□□ 1.8
RPS9-211ENST00000484121 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.26■■□□□ 1.79
RPS9-211ENST00000484121 SMARCA4P51532 1647 aa26.21■■□□□ 1.79
RPS9-211ENST00000484121 SMARCA2P51531 1590 aa26.15■■□□□ 1.78
RPS9-211ENST00000484121 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
RPS9-211ENST00000484121 HMGXB3Q12766 1538 aa26.09■■□□□ 1.77
RPS9-211ENST00000484121 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.99■■□□□ 1.75
RPS9-211ENST00000484121 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
RPS9-211ENST00000484121 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.97■■□□□ 1.75
RPS9-211ENST00000484121 ERCC6Q03468 1493 aa25.88■■□□□ 1.73
RPS9-211ENST00000484121 NESP48681 1621 aa25.83■■□□□ 1.73
RPS9-211ENST00000484121 CUX2O14529 1486 aa25.77■■□□□ 1.72
RPS9-211ENST00000484121 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.64■■□□□ 1.69
RPS9-211ENST00000484121 WIZO95785 1651 aa25.63■■□□□ 1.69
RPS9-211ENST00000484121 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.62■■□□□ 1.69
RPS9-211ENST00000484121 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.54■■□□□ 1.68
RPS9-211ENST00000484121 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
RPS9-211ENST00000484121 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.53■■□□□ 1.68
RPS9-211ENST00000484121 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
RPS9-211ENST00000484121 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.42■■□□□ 1.66
RPS9-211ENST00000484121 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
RPS9-211ENST00000484121 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.28■■□□□ 1.64
RPS9-211ENST00000484121 CFTRP13569 1480 aa25.27■■□□□ 1.64
RPS9-211ENST00000484121 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.22■■□□□ 1.63
RPS9-211ENST00000484121 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.21■■□□□ 1.63
RPS9-211ENST00000484121 WDR62O43379 1518 aa25.2■■□□□ 1.62
RPS9-211ENST00000484121 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.09■■□□□ 1.61
RPS9-211ENST00000484121 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
RPS9-211ENST00000484121 PRDM2Q13029 1718 aa24.87■■□□□ 1.57
RPS9-211ENST00000484121 TOPBP1Q92547 1522 aa24.76■■□□□ 1.55
RPS9-211ENST00000484121 IFT140Q96RY7 1462 aa24.71■■□□□ 1.55
RPS9-211ENST00000484121 ABCC8Q09428 1581 aa24.71■■□□□ 1.55
RPS9-211ENST00000484121 OSCARQ8IYS5 282 aa24.68■■□□□ 1.54
RPS9-211ENST00000484121 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
RPS9-211ENST00000484121 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.65■■□□□ 1.54
RPS9-211ENST00000484121 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
RPS9-211ENST00000484121 TRIM41Q8WV44 630 aa24.56■■□□□ 1.52
RPS9-211ENST00000484121 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
RPS9-211ENST00000484121 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
RPS9-211ENST00000484121 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.49■■□□□ 1.515e-10■■■■■ 40.2
RPS9-211ENST00000484121 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
RPS9-211ENST00000484121 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.45■■□□□ 1.5
RPS9-211ENST00000484121 SOGA1O94964 1423 aa24.44■■□□□ 1.5
RPS9-211ENST00000484121 CUX1P39880 1505 aa24.4■■□□□ 1.5
RPS9-211ENST00000484121 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.38■■□□□ 1.49
RPS9-211ENST00000484121 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
RPS9-211ENST00000484121 FBLN2P98095 1184 aa24.3■■□□□ 1.48
RPS9-211ENST00000484121 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.25■■□□□ 1.47
RPS9-211ENST00000484121 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.25■■□□□ 1.47
RPS9-211ENST00000484121 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.25■■□□□ 1.47
RPS9-211ENST00000484121 ARHGEF11O15085 1522 aa24.24■■□□□ 1.47
RPS9-211ENST00000484121 WDR97A6NE52 1622 aa24.23■■□□□ 1.47
RPS9-211ENST00000484121 CHD1O14646 1710 aa24.22■■□□□ 1.47
RPS9-211ENST00000484121 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.21■■□□□ 1.47
RPS9-211ENST00000484121 GRIN2BQ13224 1484 aa24.18■■□□□ 1.46
RPS9-211ENST00000484121 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
RPS9-211ENST00000484121 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
RPS9-211ENST00000484121 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.13■■□□□ 1.45
RPS9-211ENST00000484121 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.12■■□□□ 1.45
RPS9-211ENST00000484121 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.1■■□□□ 1.45
RPS9-211ENST00000484121 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.08■■□□□ 1.44
RPS9-211ENST00000484121 SYNJ2O15056 1496 aa24.07■■□□□ 1.44
RPS9-211ENST00000484121 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.02■■□□□ 1.44
RPS9-211ENST00000484121 ARAP1Q96P48 1450 aa24.02■■□□□ 1.44
RPS9-211ENST00000484121 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.02■■□□□ 1.44
RPS9-211ENST00000484121 TOP2BQ02880 1626 aa24.02■■□□□ 1.44
RPS9-211ENST00000484121 SYNJ1O43426 1573 aa24■■□□□ 1.43
RPS9-211ENST00000484121 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.99■■□□□ 1.43
RPS9-211ENST00000484121 PBRM1Q86U86 1689 aa23.99■■□□□ 1.43
RPS9-211ENST00000484121 GRIN2AQ12879 1464 aa23.86■■□□□ 1.41
RPS9-211ENST00000484121 ADAMTS12P58397 1594 aa23.84■■□□□ 1.41
RPS9-211ENST00000484121 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.83■■□□□ 1.4
RPS9-211ENST00000484121 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.8■■□□□ 1.4
RPS9-211ENST00000484121 NUP160Q12769 1436 aa23.79■■□□□ 1.4
RPS9-211ENST00000484121 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
RPS9-211ENST00000484121 CEP170Q5SW79 1584 aa23.74■■□□□ 1.39
RPS9-211ENST00000484121 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.67■■□□□ 1.38
RPS9-211ENST00000484121 IGF1RP08069 1367 aa23.62■■□□□ 1.37
RPS9-211ENST00000484121 SHROOM2Q13796 1616 aa23.61■■□□□ 1.37
RPS9-211ENST00000484121 KIF27Q86VH2 1401 aa23.6■■□□□ 1.37
RPS9-211ENST00000484121 JPH4Q96JJ6 628 aa23.59■■□□□ 1.37
RPS9-211ENST00000484121 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 408.1 ms