Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQQ7

SLC35C2, Solute carrier family 35 member C2, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35C2Q9NQQ7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC35C2Q9NQQ7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC35C2Q9NQQ7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC35C2Q9NQQ7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC35C2Q9NQQ7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC35C2Q9NQQ7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC35C2Q9NQQ7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC35C2Q9NQQ7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC35C2Q9NQQ7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC35C2Q9NQQ7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC35C2Q9NQQ7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC35C2Q9NQQ7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC35C2Q9NQQ7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC35C2Q9NQQ7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC35C2Q9NQQ7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC35C2Q9NQQ7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC35C2Q9NQQ7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC35C2Q9NQQ7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC35C2Q9NQQ7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC35C2Q9NQQ7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC35C2Q9NQQ7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC35C2Q9NQQ7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC35C2Q9NQQ7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC35C2Q9NQQ7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC35C2Q9NQQ7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC35C2Q9NQQ7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC35C2Q9NQQ7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC35C2Q9NQQ7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC35C2Q9NQQ7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC35C2Q9NQQ7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC35C2Q9NQQ7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC35C2Q9NQQ7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC35C2Q9NQQ7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC35C2Q9NQQ7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC35C2Q9NQQ7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC35C2Q9NQQ7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC35C2Q9NQQ7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC35C2Q9NQQ7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC35C2Q9NQQ7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC35C2Q9NQQ7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC35C2Q9NQQ7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC35C2Q9NQQ7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC35C2Q9NQQ7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC35C2Q9NQQ7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC35C2Q9NQQ7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC35C2Q9NQQ7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC35C2Q9NQQ7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC35C2Q9NQQ7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC35C2Q9NQQ7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC35C2Q9NQQ7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC35C2Q9NQQ7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC35C2Q9NQQ7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC35C2Q9NQQ7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC35C2Q9NQQ7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC35C2Q9NQQ7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC35C2Q9NQQ7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC35C2Q9NQQ7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC35C2Q9NQQ7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC35C2Q9NQQ7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC35C2Q9NQQ7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC35C2Q9NQQ7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC35C2Q9NQQ7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC35C2Q9NQQ7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC35C2Q9NQQ7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC35C2Q9NQQ7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC35C2Q9NQQ7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC35C2Q9NQQ7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC35C2Q9NQQ7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC35C2Q9NQQ7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC35C2Q9NQQ7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC35C2Q9NQQ7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC35C2Q9NQQ7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC35C2Q9NQQ7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC35C2Q9NQQ7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC35C2Q9NQQ7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC35C2Q9NQQ7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC35C2Q9NQQ7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC35C2Q9NQQ7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC35C2Q9NQQ7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC35C2Q9NQQ7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC35C2Q9NQQ7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC35C2Q9NQQ7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC35C2Q9NQQ7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC35C2Q9NQQ7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC35C2Q9NQQ7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC35C2Q9NQQ7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC35C2Q9NQQ7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC35C2Q9NQQ7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC35C2Q9NQQ7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC35C2Q9NQQ7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC35C2Q9NQQ7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC35C2Q9NQQ7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC35C2Q9NQQ7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC35C2Q9NQQ7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC35C2Q9NQQ7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC35C2Q9NQQ7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC35C2Q9NQQ7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC35C2Q9NQQ7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC35C2Q9NQQ7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC35C2Q9NQQ7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms