Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0C3

TMEM117, Transmembrane protein 117, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM117Q9H0C3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM117Q9H0C3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM117Q9H0C3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM117Q9H0C3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM117Q9H0C3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM117Q9H0C3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM117Q9H0C3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM117Q9H0C3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM117Q9H0C3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM117Q9H0C3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM117Q9H0C3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM117Q9H0C3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM117Q9H0C3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM117Q9H0C3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM117Q9H0C3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM117Q9H0C3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM117Q9H0C3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM117Q9H0C3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM117Q9H0C3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM117Q9H0C3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM117Q9H0C3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM117Q9H0C3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM117Q9H0C3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM117Q9H0C3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM117Q9H0C3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM117Q9H0C3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM117Q9H0C3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM117Q9H0C3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM117Q9H0C3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM117Q9H0C3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM117Q9H0C3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM117Q9H0C3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM117Q9H0C3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM117Q9H0C3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM117Q9H0C3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM117Q9H0C3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM117Q9H0C3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM117Q9H0C3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM117Q9H0C3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM117Q9H0C3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM117Q9H0C3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM117Q9H0C3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM117Q9H0C3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM117Q9H0C3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM117Q9H0C3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM117Q9H0C3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM117Q9H0C3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM117Q9H0C3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM117Q9H0C3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM117Q9H0C3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM117Q9H0C3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM117Q9H0C3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM117Q9H0C3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM117Q9H0C3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM117Q9H0C3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM117Q9H0C3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM117Q9H0C3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM117Q9H0C3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM117Q9H0C3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM117Q9H0C3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM117Q9H0C3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM117Q9H0C3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TMEM117Q9H0C3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM117Q9H0C3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM117Q9H0C3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM117Q9H0C3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM117Q9H0C3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM117Q9H0C3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM117Q9H0C3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM117Q9H0C3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM117Q9H0C3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TMEM117Q9H0C3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM117Q9H0C3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM117Q9H0C3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM117Q9H0C3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM117Q9H0C3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM117Q9H0C3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM117Q9H0C3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM117Q9H0C3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM117Q9H0C3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM117Q9H0C3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM117Q9H0C3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM117Q9H0C3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM117Q9H0C3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM117Q9H0C3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM117Q9H0C3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM117Q9H0C3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM117Q9H0C3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM117Q9H0C3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM117Q9H0C3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM117Q9H0C3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TMEM117Q9H0C3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
TMEM117Q9H0C3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM117Q9H0C3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM117Q9H0C3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM117Q9H0C3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM117Q9H0C3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM117Q9H0C3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM117Q9H0C3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM117Q9H0C3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms