Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWU1

CDK19, Cyclin-dependent kinase 19, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK19Q9BWU1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CDK19Q9BWU1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CDK19Q9BWU1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CDK19Q9BWU1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CDK19Q9BWU1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
CDK19Q9BWU1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
CDK19Q9BWU1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CDK19Q9BWU1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CDK19Q9BWU1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CDK19Q9BWU1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CDK19Q9BWU1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CDK19Q9BWU1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CDK19Q9BWU1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CDK19Q9BWU1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CDK19Q9BWU1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CDK19Q9BWU1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CDK19Q9BWU1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CDK19Q9BWU1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CDK19Q9BWU1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CDK19Q9BWU1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
CDK19Q9BWU1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CDK19Q9BWU1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
CDK19Q9BWU1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CDK19Q9BWU1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CDK19Q9BWU1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CDK19Q9BWU1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
CDK19Q9BWU1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CDK19Q9BWU1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CDK19Q9BWU1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CDK19Q9BWU1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CDK19Q9BWU1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
CDK19Q9BWU1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CDK19Q9BWU1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CDK19Q9BWU1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CDK19Q9BWU1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CDK19Q9BWU1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CDK19Q9BWU1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CDK19Q9BWU1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CDK19Q9BWU1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CDK19Q9BWU1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CDK19Q9BWU1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CDK19Q9BWU1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CDK19Q9BWU1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CDK19Q9BWU1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CDK19Q9BWU1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CDK19Q9BWU1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CDK19Q9BWU1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CDK19Q9BWU1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CDK19Q9BWU1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CDK19Q9BWU1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CDK19Q9BWU1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CDK19Q9BWU1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CDK19Q9BWU1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CDK19Q9BWU1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CDK19Q9BWU1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDK19Q9BWU1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CDK19Q9BWU1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDK19Q9BWU1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDK19Q9BWU1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDK19Q9BWU1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CDK19Q9BWU1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDK19Q9BWU1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CDK19Q9BWU1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CDK19Q9BWU1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CDK19Q9BWU1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CDK19Q9BWU1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CDK19Q9BWU1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CDK19Q9BWU1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CDK19Q9BWU1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CDK19Q9BWU1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
CDK19Q9BWU1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CDK19Q9BWU1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
CDK19Q9BWU1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CDK19Q9BWU1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CDK19Q9BWU1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CDK19Q9BWU1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CDK19Q9BWU1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CDK19Q9BWU1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CDK19Q9BWU1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CDK19Q9BWU1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CDK19Q9BWU1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CDK19Q9BWU1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CDK19Q9BWU1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CDK19Q9BWU1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CDK19Q9BWU1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CDK19Q9BWU1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CDK19Q9BWU1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CDK19Q9BWU1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CDK19Q9BWU1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CDK19Q9BWU1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CDK19Q9BWU1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CDK19Q9BWU1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
CDK19Q9BWU1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
CDK19Q9BWU1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CDK19Q9BWU1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CDK19Q9BWU1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CDK19Q9BWU1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CDK19Q9BWU1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CDK19Q9BWU1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CDK19Q9BWU1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms