Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MTA3Q9BTC8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MTA3Q9BTC8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MTA3Q9BTC8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MTA3Q9BTC8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MTA3Q9BTC8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MTA3Q9BTC8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MTA3Q9BTC8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MTA3Q9BTC8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MTA3Q9BTC8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MTA3Q9BTC8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MTA3Q9BTC8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MTA3Q9BTC8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MTA3Q9BTC8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MTA3Q9BTC8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MTA3Q9BTC8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MTA3Q9BTC8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MTA3Q9BTC8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MTA3Q9BTC8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MTA3Q9BTC8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MTA3Q9BTC8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
MTA3Q9BTC8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MTA3Q9BTC8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MTA3Q9BTC8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MTA3Q9BTC8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MTA3Q9BTC8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MTA3Q9BTC8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MTA3Q9BTC8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MTA3Q9BTC8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MTA3Q9BTC8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MTA3Q9BTC8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MTA3Q9BTC8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MTA3Q9BTC8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
MTA3Q9BTC8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MTA3Q9BTC8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MTA3Q9BTC8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MTA3Q9BTC8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MTA3Q9BTC8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MTA3Q9BTC8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MTA3Q9BTC8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
MTA3Q9BTC8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MTA3Q9BTC8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MTA3Q9BTC8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MTA3Q9BTC8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MTA3Q9BTC8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MTA3Q9BTC8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MTA3Q9BTC8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MTA3Q9BTC8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MTA3Q9BTC8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MTA3Q9BTC8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MTA3Q9BTC8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MTA3Q9BTC8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MTA3Q9BTC8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MTA3Q9BTC8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MTA3Q9BTC8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MTA3Q9BTC8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MTA3Q9BTC8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MTA3Q9BTC8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MTA3Q9BTC8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MTA3Q9BTC8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
MTA3Q9BTC8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MTA3Q9BTC8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MTA3Q9BTC8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MTA3Q9BTC8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MTA3Q9BTC8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MTA3Q9BTC8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MTA3Q9BTC8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MTA3Q9BTC8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MTA3Q9BTC8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MTA3Q9BTC8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MTA3Q9BTC8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
MTA3Q9BTC8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MTA3Q9BTC8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MTA3Q9BTC8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MTA3Q9BTC8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MTA3Q9BTC8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MTA3Q9BTC8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MTA3Q9BTC8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MTA3Q9BTC8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
MTA3Q9BTC8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MTA3Q9BTC8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MTA3Q9BTC8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MTA3Q9BTC8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MTA3Q9BTC8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MTA3Q9BTC8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MTA3Q9BTC8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MTA3Q9BTC8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MTA3Q9BTC8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MTA3Q9BTC8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MTA3Q9BTC8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MTA3Q9BTC8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MTA3Q9BTC8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MTA3Q9BTC8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MTA3Q9BTC8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MTA3Q9BTC8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MTA3Q9BTC8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MTA3Q9BTC8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MTA3Q9BTC8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MTA3Q9BTC8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MTA3Q9BTC8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms