Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.21■■■■■ 4.03
MTA3Q9BTC8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
MTA3Q9BTC8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
MTA3Q9BTC8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
MTA3Q9BTC8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
MTA3Q9BTC8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
MTA3Q9BTC8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
MTA3Q9BTC8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.76
MTA3Q9BTC8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
MTA3Q9BTC8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
MTA3Q9BTC8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
MTA3Q9BTC8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
MTA3Q9BTC8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
MTA3Q9BTC8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
MTA3Q9BTC8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
MTA3Q9BTC8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
MTA3Q9BTC8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
MTA3Q9BTC8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
MTA3Q9BTC8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
MTA3Q9BTC8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
MTA3Q9BTC8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
MTA3Q9BTC8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
MTA3Q9BTC8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
MTA3Q9BTC8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
MTA3Q9BTC8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
MTA3Q9BTC8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
MTA3Q9BTC8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
MTA3Q9BTC8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
MTA3Q9BTC8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
MTA3Q9BTC8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
MTA3Q9BTC8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
MTA3Q9BTC8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
MTA3Q9BTC8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
MTA3Q9BTC8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
MTA3Q9BTC8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
MTA3Q9BTC8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
MTA3Q9BTC8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
MTA3Q9BTC8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
MTA3Q9BTC8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
MTA3Q9BTC8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
MTA3Q9BTC8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
MTA3Q9BTC8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
MTA3Q9BTC8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
MTA3Q9BTC8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
MTA3Q9BTC8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
MTA3Q9BTC8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
MTA3Q9BTC8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
MTA3Q9BTC8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
MTA3Q9BTC8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
MTA3Q9BTC8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
MTA3Q9BTC8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
MTA3Q9BTC8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
MTA3Q9BTC8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
MTA3Q9BTC8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
MTA3Q9BTC8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
MTA3Q9BTC8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
MTA3Q9BTC8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
MTA3Q9BTC8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
MTA3Q9BTC8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
MTA3Q9BTC8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
MTA3Q9BTC8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
MTA3Q9BTC8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
MTA3Q9BTC8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
MTA3Q9BTC8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
MTA3Q9BTC8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
MTA3Q9BTC8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
MTA3Q9BTC8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
MTA3Q9BTC8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
MTA3Q9BTC8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
MTA3Q9BTC8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
MTA3Q9BTC8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
MTA3Q9BTC8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
MTA3Q9BTC8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
MTA3Q9BTC8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
MTA3Q9BTC8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
MTA3Q9BTC8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
MTA3Q9BTC8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
MTA3Q9BTC8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
MTA3Q9BTC8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
MTA3Q9BTC8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
MTA3Q9BTC8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
MTA3Q9BTC8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
MTA3Q9BTC8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
MTA3Q9BTC8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
MTA3Q9BTC8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
MTA3Q9BTC8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
MTA3Q9BTC8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
MTA3Q9BTC8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
MTA3Q9BTC8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
MTA3Q9BTC8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
MTA3Q9BTC8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
MTA3Q9BTC8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
MTA3Q9BTC8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
MTA3Q9BTC8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
MTA3Q9BTC8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
MTA3Q9BTC8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
MTA3Q9BTC8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
MTA3Q9BTC8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
MTA3Q9BTC8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
MTA3Q9BTC8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms