Protein–RNA interactions for Protein: Q96HP8

TMEM176A, Transmembrane protein 176A, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM176AQ96HP8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM176AQ96HP8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM176AQ96HP8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM176AQ96HP8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM176AQ96HP8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM176AQ96HP8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM176AQ96HP8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM176AQ96HP8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM176AQ96HP8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM176AQ96HP8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM176AQ96HP8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM176AQ96HP8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM176AQ96HP8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM176AQ96HP8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM176AQ96HP8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM176AQ96HP8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM176AQ96HP8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM176AQ96HP8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM176AQ96HP8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM176AQ96HP8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM176AQ96HP8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM176AQ96HP8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM176AQ96HP8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM176AQ96HP8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM176AQ96HP8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM176AQ96HP8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM176AQ96HP8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM176AQ96HP8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM176AQ96HP8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM176AQ96HP8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM176AQ96HP8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM176AQ96HP8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM176AQ96HP8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM176AQ96HP8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM176AQ96HP8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM176AQ96HP8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM176AQ96HP8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM176AQ96HP8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM176AQ96HP8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM176AQ96HP8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM176AQ96HP8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM176AQ96HP8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM176AQ96HP8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM176AQ96HP8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM176AQ96HP8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM176AQ96HP8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM176AQ96HP8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM176AQ96HP8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM176AQ96HP8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM176AQ96HP8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM176AQ96HP8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM176AQ96HP8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM176AQ96HP8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM176AQ96HP8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM176AQ96HP8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms