Protein–RNA interactions for Protein: Q92604

LPGAT1, Acyl-CoA:lysophosphatidylglycerol acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPGAT1Q92604 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LPGAT1Q92604 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LPGAT1Q92604 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LPGAT1Q92604 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LPGAT1Q92604 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LPGAT1Q92604 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LPGAT1Q92604 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LPGAT1Q92604 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LPGAT1Q92604 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LPGAT1Q92604 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LPGAT1Q92604 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LPGAT1Q92604 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LPGAT1Q92604 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPGAT1Q92604 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPGAT1Q92604 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPGAT1Q92604 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPGAT1Q92604 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPGAT1Q92604 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPGAT1Q92604 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LPGAT1Q92604 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LPGAT1Q92604 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LPGAT1Q92604 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LPGAT1Q92604 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LPGAT1Q92604 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LPGAT1Q92604 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LPGAT1Q92604 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LPGAT1Q92604 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LPGAT1Q92604 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LPGAT1Q92604 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LPGAT1Q92604 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LPGAT1Q92604 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LPGAT1Q92604 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LPGAT1Q92604 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LPGAT1Q92604 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LPGAT1Q92604 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LPGAT1Q92604 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LPGAT1Q92604 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LPGAT1Q92604 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LPGAT1Q92604 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LPGAT1Q92604 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LPGAT1Q92604 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LPGAT1Q92604 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LPGAT1Q92604 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LPGAT1Q92604 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LPGAT1Q92604 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LPGAT1Q92604 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LPGAT1Q92604 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LPGAT1Q92604 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LPGAT1Q92604 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LPGAT1Q92604 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LPGAT1Q92604 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LPGAT1Q92604 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LPGAT1Q92604 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LPGAT1Q92604 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LPGAT1Q92604 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LPGAT1Q92604 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LPGAT1Q92604 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LPGAT1Q92604 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LPGAT1Q92604 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LPGAT1Q92604 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LPGAT1Q92604 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LPGAT1Q92604 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LPGAT1Q92604 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LPGAT1Q92604 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LPGAT1Q92604 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LPGAT1Q92604 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LPGAT1Q92604 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LPGAT1Q92604 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LPGAT1Q92604 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LPGAT1Q92604 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LPGAT1Q92604 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LPGAT1Q92604 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LPGAT1Q92604 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LPGAT1Q92604 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LPGAT1Q92604 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LPGAT1Q92604 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LPGAT1Q92604 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LPGAT1Q92604 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LPGAT1Q92604 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LPGAT1Q92604 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LPGAT1Q92604 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LPGAT1Q92604 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LPGAT1Q92604 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LPGAT1Q92604 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LPGAT1Q92604 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LPGAT1Q92604 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LPGAT1Q92604 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LPGAT1Q92604 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LPGAT1Q92604 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LPGAT1Q92604 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LPGAT1Q92604 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LPGAT1Q92604 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LPGAT1Q92604 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LPGAT1Q92604 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LPGAT1Q92604 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LPGAT1Q92604 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LPGAT1Q92604 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LPGAT1Q92604 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LPGAT1Q92604 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LPGAT1Q92604 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms