Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
USP31Q70CQ4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
USP31Q70CQ4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
USP31Q70CQ4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
USP31Q70CQ4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
USP31Q70CQ4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
USP31Q70CQ4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
USP31Q70CQ4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
USP31Q70CQ4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
USP31Q70CQ4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
USP31Q70CQ4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
USP31Q70CQ4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
USP31Q70CQ4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
USP31Q70CQ4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
USP31Q70CQ4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
USP31Q70CQ4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
USP31Q70CQ4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
USP31Q70CQ4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
USP31Q70CQ4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
USP31Q70CQ4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
USP31Q70CQ4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
USP31Q70CQ4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
USP31Q70CQ4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
USP31Q70CQ4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
USP31Q70CQ4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
USP31Q70CQ4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
USP31Q70CQ4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
USP31Q70CQ4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
USP31Q70CQ4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
USP31Q70CQ4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.94
USP31Q70CQ4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
USP31Q70CQ4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
USP31Q70CQ4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
USP31Q70CQ4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
USP31Q70CQ4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
USP31Q70CQ4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
USP31Q70CQ4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
USP31Q70CQ4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
USP31Q70CQ4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
USP31Q70CQ4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
USP31Q70CQ4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
USP31Q70CQ4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
USP31Q70CQ4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
USP31Q70CQ4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
USP31Q70CQ4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.41■■■□□ 2.94
USP31Q70CQ4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
USP31Q70CQ4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
USP31Q70CQ4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
USP31Q70CQ4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
USP31Q70CQ4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
USP31Q70CQ4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
USP31Q70CQ4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
USP31Q70CQ4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
USP31Q70CQ4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
USP31Q70CQ4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
USP31Q70CQ4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
USP31Q70CQ4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
USP31Q70CQ4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
USP31Q70CQ4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
USP31Q70CQ4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
USP31Q70CQ4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
USP31Q70CQ4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
USP31Q70CQ4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
USP31Q70CQ4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
USP31Q70CQ4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
USP31Q70CQ4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
USP31Q70CQ4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
USP31Q70CQ4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
USP31Q70CQ4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
USP31Q70CQ4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
USP31Q70CQ4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
USP31Q70CQ4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
USP31Q70CQ4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
USP31Q70CQ4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
USP31Q70CQ4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
USP31Q70CQ4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
USP31Q70CQ4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
USP31Q70CQ4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
USP31Q70CQ4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
USP31Q70CQ4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
USP31Q70CQ4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
USP31Q70CQ4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
USP31Q70CQ4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
USP31Q70CQ4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
USP31Q70CQ4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
USP31Q70CQ4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
USP31Q70CQ4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
USP31Q70CQ4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
USP31Q70CQ4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
USP31Q70CQ4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
USP31Q70CQ4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
USP31Q70CQ4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
USP31Q70CQ4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
USP31Q70CQ4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
USP31Q70CQ4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
USP31Q70CQ4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
USP31Q70CQ4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
USP31Q70CQ4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
USP31Q70CQ4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
USP31Q70CQ4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms