Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
EDC4Q6P2E9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
EDC4Q6P2E9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
EDC4Q6P2E9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
EDC4Q6P2E9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
EDC4Q6P2E9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
EDC4Q6P2E9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
EDC4Q6P2E9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
EDC4Q6P2E9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
EDC4Q6P2E9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
EDC4Q6P2E9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
EDC4Q6P2E9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
EDC4Q6P2E9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
EDC4Q6P2E9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
EDC4Q6P2E9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
EDC4Q6P2E9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
EDC4Q6P2E9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
EDC4Q6P2E9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
EDC4Q6P2E9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
EDC4Q6P2E9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
EDC4Q6P2E9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
EDC4Q6P2E9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
EDC4Q6P2E9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
EDC4Q6P2E9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
EDC4Q6P2E9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
EDC4Q6P2E9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
EDC4Q6P2E9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
EDC4Q6P2E9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
EDC4Q6P2E9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
EDC4Q6P2E9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
EDC4Q6P2E9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
EDC4Q6P2E9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
EDC4Q6P2E9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
EDC4Q6P2E9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
EDC4Q6P2E9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
EDC4Q6P2E9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
EDC4Q6P2E9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
EDC4Q6P2E9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
EDC4Q6P2E9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
EDC4Q6P2E9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
EDC4Q6P2E9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
EDC4Q6P2E9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
EDC4Q6P2E9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
EDC4Q6P2E9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
EDC4Q6P2E9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
EDC4Q6P2E9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
EDC4Q6P2E9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
EDC4Q6P2E9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
EDC4Q6P2E9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
EDC4Q6P2E9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
EDC4Q6P2E9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
EDC4Q6P2E9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
EDC4Q6P2E9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
EDC4Q6P2E9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
EDC4Q6P2E9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
EDC4Q6P2E9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
EDC4Q6P2E9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
EDC4Q6P2E9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
EDC4Q6P2E9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
EDC4Q6P2E9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
EDC4Q6P2E9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
EDC4Q6P2E9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
EDC4Q6P2E9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
EDC4Q6P2E9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
EDC4Q6P2E9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
EDC4Q6P2E9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
EDC4Q6P2E9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
EDC4Q6P2E9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
EDC4Q6P2E9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
EDC4Q6P2E9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
EDC4Q6P2E9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
EDC4Q6P2E9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
EDC4Q6P2E9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
EDC4Q6P2E9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
EDC4Q6P2E9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
EDC4Q6P2E9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
EDC4Q6P2E9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
EDC4Q6P2E9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
EDC4Q6P2E9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
EDC4Q6P2E9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
EDC4Q6P2E9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
EDC4Q6P2E9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
EDC4Q6P2E9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
EDC4Q6P2E9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
EDC4Q6P2E9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
EDC4Q6P2E9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
EDC4Q6P2E9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
EDC4Q6P2E9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
EDC4Q6P2E9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
EDC4Q6P2E9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
EDC4Q6P2E9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
EDC4Q6P2E9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
EDC4Q6P2E9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
EDC4Q6P2E9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
EDC4Q6P2E9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
EDC4Q6P2E9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
EDC4Q6P2E9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
EDC4Q6P2E9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
EDC4Q6P2E9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
EDC4Q6P2E9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms