Protein–RNA interactions for Protein: Q6IS24

GALNT17, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 17, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT17Q6IS24 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GALNT17Q6IS24 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GALNT17Q6IS24 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GALNT17Q6IS24 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GALNT17Q6IS24 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GALNT17Q6IS24 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GALNT17Q6IS24 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GALNT17Q6IS24 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GALNT17Q6IS24 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GALNT17Q6IS24 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GALNT17Q6IS24 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GALNT17Q6IS24 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GALNT17Q6IS24 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GALNT17Q6IS24 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GALNT17Q6IS24 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GALNT17Q6IS24 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GALNT17Q6IS24 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GALNT17Q6IS24 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GALNT17Q6IS24 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GALNT17Q6IS24 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GALNT17Q6IS24 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GALNT17Q6IS24 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GALNT17Q6IS24 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GALNT17Q6IS24 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GALNT17Q6IS24 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GALNT17Q6IS24 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GALNT17Q6IS24 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GALNT17Q6IS24 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GALNT17Q6IS24 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GALNT17Q6IS24 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GALNT17Q6IS24 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GALNT17Q6IS24 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GALNT17Q6IS24 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GALNT17Q6IS24 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GALNT17Q6IS24 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GALNT17Q6IS24 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GALNT17Q6IS24 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GALNT17Q6IS24 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GALNT17Q6IS24 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GALNT17Q6IS24 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GALNT17Q6IS24 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GALNT17Q6IS24 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GALNT17Q6IS24 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GALNT17Q6IS24 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GALNT17Q6IS24 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GALNT17Q6IS24 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GALNT17Q6IS24 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
GALNT17Q6IS24 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GALNT17Q6IS24 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GALNT17Q6IS24 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GALNT17Q6IS24 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GALNT17Q6IS24 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GALNT17Q6IS24 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GALNT17Q6IS24 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GALNT17Q6IS24 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GALNT17Q6IS24 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GALNT17Q6IS24 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GALNT17Q6IS24 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GALNT17Q6IS24 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GALNT17Q6IS24 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GALNT17Q6IS24 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GALNT17Q6IS24 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GALNT17Q6IS24 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GALNT17Q6IS24 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GALNT17Q6IS24 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GALNT17Q6IS24 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GALNT17Q6IS24 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GALNT17Q6IS24 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GALNT17Q6IS24 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GALNT17Q6IS24 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GALNT17Q6IS24 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GALNT17Q6IS24 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GALNT17Q6IS24 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GALNT17Q6IS24 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GALNT17Q6IS24 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GALNT17Q6IS24 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GALNT17Q6IS24 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GALNT17Q6IS24 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GALNT17Q6IS24 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GALNT17Q6IS24 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GALNT17Q6IS24 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GALNT17Q6IS24 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GALNT17Q6IS24 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GALNT17Q6IS24 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GALNT17Q6IS24 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GALNT17Q6IS24 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
GALNT17Q6IS24 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GALNT17Q6IS24 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GALNT17Q6IS24 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GALNT17Q6IS24 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GALNT17Q6IS24 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GALNT17Q6IS24 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GALNT17Q6IS24 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GALNT17Q6IS24 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GALNT17Q6IS24 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GALNT17Q6IS24 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GALNT17Q6IS24 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GALNT17Q6IS24 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GALNT17Q6IS24 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GALNT17Q6IS24 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms