Protein–RNA interactions for Protein: Q5H9E4

SLC25A53, Solute carrier family 25 member 53, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A53Q5H9E4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A53Q5H9E4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A53Q5H9E4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC25A53Q5H9E4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A53Q5H9E4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A53Q5H9E4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A53Q5H9E4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A53Q5H9E4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A53Q5H9E4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A53Q5H9E4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A53Q5H9E4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A53Q5H9E4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A53Q5H9E4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A53Q5H9E4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A53Q5H9E4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A53Q5H9E4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A53Q5H9E4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A53Q5H9E4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A53Q5H9E4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A53Q5H9E4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A53Q5H9E4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A53Q5H9E4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC25A53Q5H9E4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A53Q5H9E4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A53Q5H9E4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A53Q5H9E4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A53Q5H9E4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A53Q5H9E4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A53Q5H9E4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A53Q5H9E4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A53Q5H9E4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A53Q5H9E4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A53Q5H9E4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A53Q5H9E4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A53Q5H9E4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A53Q5H9E4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A53Q5H9E4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A53Q5H9E4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A53Q5H9E4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A53Q5H9E4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A53Q5H9E4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A53Q5H9E4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A53Q5H9E4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A53Q5H9E4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A53Q5H9E4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A53Q5H9E4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A53Q5H9E4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A53Q5H9E4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A53Q5H9E4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A53Q5H9E4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A53Q5H9E4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A53Q5H9E4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A53Q5H9E4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A53Q5H9E4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A53Q5H9E4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A53Q5H9E4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC25A53Q5H9E4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC25A53Q5H9E4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC25A53Q5H9E4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC25A53Q5H9E4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC25A53Q5H9E4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC25A53Q5H9E4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A53Q5H9E4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A53Q5H9E4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A53Q5H9E4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A53Q5H9E4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A53Q5H9E4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A53Q5H9E4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A53Q5H9E4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A53Q5H9E4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A53Q5H9E4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A53Q5H9E4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A53Q5H9E4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A53Q5H9E4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC25A53Q5H9E4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A53Q5H9E4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A53Q5H9E4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A53Q5H9E4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A53Q5H9E4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A53Q5H9E4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A53Q5H9E4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A53Q5H9E4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A53Q5H9E4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A53Q5H9E4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A53Q5H9E4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC25A53Q5H9E4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC25A53Q5H9E4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC25A53Q5H9E4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC25A53Q5H9E4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC25A53Q5H9E4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC25A53Q5H9E4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC25A53Q5H9E4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC25A53Q5H9E4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC25A53Q5H9E4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC25A53Q5H9E4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC25A53Q5H9E4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC25A53Q5H9E4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC25A53Q5H9E4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC25A53Q5H9E4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC25A53Q5H9E4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms