Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAA8

TSNAXIP1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNAXIP1Q2TAA8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSNAXIP1Q2TAA8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSNAXIP1Q2TAA8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TSNAXIP1Q2TAA8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSNAXIP1Q2TAA8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSNAXIP1Q2TAA8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSNAXIP1Q2TAA8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TSNAXIP1Q2TAA8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSNAXIP1Q2TAA8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSNAXIP1Q2TAA8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSNAXIP1Q2TAA8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSNAXIP1Q2TAA8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSNAXIP1Q2TAA8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSNAXIP1Q2TAA8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSNAXIP1Q2TAA8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSNAXIP1Q2TAA8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSNAXIP1Q2TAA8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSNAXIP1Q2TAA8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSNAXIP1Q2TAA8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSNAXIP1Q2TAA8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSNAXIP1Q2TAA8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSNAXIP1Q2TAA8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSNAXIP1Q2TAA8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSNAXIP1Q2TAA8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSNAXIP1Q2TAA8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSNAXIP1Q2TAA8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSNAXIP1Q2TAA8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSNAXIP1Q2TAA8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSNAXIP1Q2TAA8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSNAXIP1Q2TAA8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSNAXIP1Q2TAA8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSNAXIP1Q2TAA8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSNAXIP1Q2TAA8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSNAXIP1Q2TAA8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSNAXIP1Q2TAA8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSNAXIP1Q2TAA8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSNAXIP1Q2TAA8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSNAXIP1Q2TAA8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSNAXIP1Q2TAA8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSNAXIP1Q2TAA8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSNAXIP1Q2TAA8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSNAXIP1Q2TAA8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSNAXIP1Q2TAA8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSNAXIP1Q2TAA8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSNAXIP1Q2TAA8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSNAXIP1Q2TAA8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSNAXIP1Q2TAA8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSNAXIP1Q2TAA8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSNAXIP1Q2TAA8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSNAXIP1Q2TAA8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSNAXIP1Q2TAA8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSNAXIP1Q2TAA8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSNAXIP1Q2TAA8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSNAXIP1Q2TAA8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSNAXIP1Q2TAA8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSNAXIP1Q2TAA8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSNAXIP1Q2TAA8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSNAXIP1Q2TAA8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TSNAXIP1Q2TAA8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSNAXIP1Q2TAA8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSNAXIP1Q2TAA8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSNAXIP1Q2TAA8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSNAXIP1Q2TAA8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSNAXIP1Q2TAA8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSNAXIP1Q2TAA8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSNAXIP1Q2TAA8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSNAXIP1Q2TAA8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSNAXIP1Q2TAA8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSNAXIP1Q2TAA8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSNAXIP1Q2TAA8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSNAXIP1Q2TAA8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSNAXIP1Q2TAA8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSNAXIP1Q2TAA8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSNAXIP1Q2TAA8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSNAXIP1Q2TAA8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSNAXIP1Q2TAA8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSNAXIP1Q2TAA8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSNAXIP1Q2TAA8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSNAXIP1Q2TAA8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSNAXIP1Q2TAA8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSNAXIP1Q2TAA8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSNAXIP1Q2TAA8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSNAXIP1Q2TAA8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSNAXIP1Q2TAA8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSNAXIP1Q2TAA8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSNAXIP1Q2TAA8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSNAXIP1Q2TAA8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSNAXIP1Q2TAA8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSNAXIP1Q2TAA8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSNAXIP1Q2TAA8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSNAXIP1Q2TAA8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSNAXIP1Q2TAA8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSNAXIP1Q2TAA8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms