Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTN1Q12860 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTN1Q12860 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTN1Q12860 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTN1Q12860 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTN1Q12860 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTN1Q12860 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTN1Q12860 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTN1Q12860 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTN1Q12860 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTN1Q12860 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTN1Q12860 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTN1Q12860 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTN1Q12860 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTN1Q12860 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTN1Q12860 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTN1Q12860 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTN1Q12860 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTN1Q12860 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTN1Q12860 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTN1Q12860 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTN1Q12860 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTN1Q12860 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTN1Q12860 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTN1Q12860 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTN1Q12860 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTN1Q12860 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTN1Q12860 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTN1Q12860 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTN1Q12860 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTN1Q12860 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTN1Q12860 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTN1Q12860 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTN1Q12860 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNTN1Q12860 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNTN1Q12860 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTN1Q12860 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTN1Q12860 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTN1Q12860 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTN1Q12860 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTN1Q12860 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTN1Q12860 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTN1Q12860 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNTN1Q12860 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTN1Q12860 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTN1Q12860 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTN1Q12860 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTN1Q12860 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTN1Q12860 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNTN1Q12860 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTN1Q12860 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTN1Q12860 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTN1Q12860 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTN1Q12860 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTN1Q12860 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNTN1Q12860 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTN1Q12860 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTN1Q12860 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTN1Q12860 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTN1Q12860 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTN1Q12860 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTN1Q12860 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTN1Q12860 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNTN1Q12860 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTN1Q12860 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTN1Q12860 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTN1Q12860 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTN1Q12860 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTN1Q12860 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTN1Q12860 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNTN1Q12860 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTN1Q12860 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNTN1Q12860 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNTN1Q12860 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTN1Q12860 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTN1Q12860 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNTN1Q12860 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTN1Q12860 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTN1Q12860 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTN1Q12860 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTN1Q12860 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTN1Q12860 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNTN1Q12860 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTN1Q12860 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTN1Q12860 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTN1Q12860 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTN1Q12860 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTN1Q12860 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTN1Q12860 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTN1Q12860 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTN1Q12860 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTN1Q12860 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTN1Q12860 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNTN1Q12860 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNTN1Q12860 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTN1Q12860 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTN1Q12860 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTN1Q12860 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTN1Q12860 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNTN1Q12860 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
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