Protein–RNA interactions for Protein: Q12849

GRSF1, G-rich sequence factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRSF1Q12849 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.13e-7■■■□□ 17.4
GRSF1Q12849 CARHSP1-207ENST00000565287 556 ntTSL 314.37□□□□□ -0.113e-7■■■□□ 17.4
GRSF1Q12849 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.243e-7■■■□□ 17.4
GRSF1Q12849 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.353e-7■■■□□ 17.4
GRSF1Q12849 VAV2-205ENST00000486113 523 ntTSL 213.39□□□□□ -0.271e-7■■■□□ 17.4
GRSF1Q12849 DHRS2-204ENST00000553600 844 ntTSL 214.89□□□□□ -0.032e-16■■■□□ 17.4
GRSF1Q12849 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.872e-13■■■□□ 17.4
GRSF1Q12849 NSUN2-203ENST00000504374 3217 ntTSL 216.66■□□□□ 0.262e-13■■■□□ 17.4
GRSF1Q12849 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.142e-13■■■□□ 17.4
GRSF1Q12849 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.332e-8■■■□□ 17.3
GRSF1Q12849 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.122e-8■■■□□ 17.3
GRSF1Q12849 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.812e-8■■■□□ 17.3
GRSF1Q12849 TMEM64-206ENST00000521852 587 ntTSL 419.74■□□□□ 0.752e-8■■■□□ 17.3
GRSF1Q12849 AGRN-205ENST00000469403 899 ntTSL 327.12■■□□□ 1.932e-7■■■□□ 17.2
GRSF1Q12849 AGRN-206ENST00000477585 707 ntTSL 325.49■■□□□ 1.672e-7■■■□□ 17.2
GRSF1Q12849 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.12e-7■■■□□ 17.2
GRSF1Q12849 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.152e-7■■■□□ 17.2
GRSF1Q12849 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.322e-12■■■□□ 17.2
GRSF1Q12849 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.112e-12■■■□□ 17.2
GRSF1Q12849 LITAF-203ENST00000413364 2292 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.382e-12■■■□□ 17.2
GRSF1Q12849 LITAF-221ENST00000622633 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.422e-12■■■□□ 17.2
GRSF1Q12849 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.213e-9■■■□□ 17.2
GRSF1Q12849 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.063e-9■■■□□ 17.2
GRSF1Q12849 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.62■■□□□ 1.053e-9■■■□□ 17.2
GRSF1Q12849 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.173e-9■■■□□ 17.2
GRSF1Q12849 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.989e-7■■■□□ 17.1
GRSF1Q12849 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.883e-7■■■□□ 17.1
GRSF1Q12849 TNK2-216ENST00000468819 876 ntTSL 1 (best)21.08■□□□□ 0.973e-7■■■□□ 17.1
GRSF1Q12849 SFXN4-207ENST00000484960 555 ntTSL 314.61□□□□□ -0.073e-7■■■□□ 17.1
GRSF1Q12849 SFXN4-208ENST00000490417 952 ntTSL 214.37□□□□□ -0.113e-7■■■□□ 17.1
GRSF1Q12849 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.153e-7■■■□□ 17.1
GRSF1Q12849 ASPHD1-202ENST00000414952 1451 ntTSL 224.71■■□□□ 1.551e-6■■■□□ 17
GRSF1Q12849 ASPHD1-205ENST00000566693 1732 ntTSL 1 (best)24.66■■□□□ 1.541e-6■■■□□ 17
GRSF1Q12849 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.851e-6■■■□□ 17
GRSF1Q12849 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.811e-6■■■□□ 17
GRSF1Q12849 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.392e-6■■■□□ 17
GRSF1Q12849 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.815e-12■■■□□ 16.9
GRSF1Q12849 FAM120A-203ENST00000427765 1710 ntTSL 1 (best)20.01■□□□□ 0.795e-12■■■□□ 16.9
GRSF1Q12849 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.532e-14■■■□□ 16.9
GRSF1Q12849 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.22e-14■■■□□ 16.9
GRSF1Q12849 PYCR1-212ENST00000583564 377 ntTSL 321.14■□□□□ 0.972e-14■■■□□ 16.9
GRSF1Q12849 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.962e-14■■■□□ 16.9
GRSF1Q12849 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.782e-14■■■□□ 16.9
GRSF1Q12849 PYCR1-209ENST00000579698 572 ntTSL 419.9■□□□□ 0.782e-14■■■□□ 16.9
GRSF1Q12849 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.74e-6■■■□□ 16.9
GRSF1Q12849 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.544e-6■■■□□ 16.9
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GRSF1Q12849 PYCR1-214ENST00000585215 767 ntTSL 418.05■□□□□ 0.482e-14■■■□□ 16.9
GRSF1Q12849 PYCR1-210ENST00000581271 528 ntTSL 417.84■□□□□ 0.452e-14■■■□□ 16.9
GRSF1Q12849 PYCR1-206ENST00000577624 510 ntTSL 317.82■□□□□ 0.442e-14■■■□□ 16.9
GRSF1Q12849 PYCR1-205ENST00000405481 841 ntTSL 215.93■□□□□ 0.142e-14■■■□□ 16.9
GRSF1Q12849 PYCR1-211ENST00000582198 868 ntTSL 514.63□□□□□ -0.072e-14■■■□□ 16.9
GRSF1Q12849 PYCR1-215ENST00000585244 578 ntTSL 414.53□□□□□ -0.082e-14■■■□□ 16.9
GRSF1Q12849 PYCR1-208ENST00000579366 681 ntTSL 311.96□□□□□ -0.492e-14■■■□□ 16.9
GRSF1Q12849 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.461e-7■■■□□ 16.9
GRSF1Q12849 RAVER1-203ENST00000591969 742 ntTSL 317.28■□□□□ 0.361e-7■■■□□ 16.9
GRSF1Q12849 RAVER1-204ENST00000592208 4693 ntTSL 1 (best)14.48□□□□□ -0.091e-7■■■□□ 16.9
GRSF1Q12849 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.21e-7■■■□□ 16.9
GRSF1Q12849 RAVER1-201ENST00000293677 3595 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.51e-7■■■□□ 16.9
GRSF1Q12849 RAVER1-208ENST00000617231 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.681e-7■■■□□ 16.9
GRSF1Q12849 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.151e-6■■■□□ 16.8
GRSF1Q12849 FUS-209ENST00000566605 1787 ntTSL 1 (best)25.03■■□□□ 1.63e-10■■■□□ 16.8
GRSF1Q12849 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.493e-10■■■□□ 16.8
GRSF1Q12849 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.293e-10■■■□□ 16.8
GRSF1Q12849 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.063e-10■■■□□ 16.8
GRSF1Q12849 FUS-206ENST00000487509 4920 ntTSL 213.59□□□□□ -0.233e-10■■■□□ 16.8
GRSF1Q12849 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.247e-12■■■□□ 16.7
GRSF1Q12849 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.17e-12■■■□□ 16.7
GRSF1Q12849 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.147e-12■■■□□ 16.7
GRSF1Q12849 SLC38A10-210ENST00000573058 1627 nt25.23■■□□□ 1.631e-8■■■□□ 16.7
GRSF1Q12849 SLC38A10-206ENST00000540966 896 ntTSL 318.01■□□□□ 0.471e-8■■■□□ 16.7
GRSF1Q12849 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.441e-8■■■□□ 16.7
GRSF1Q12849 SLC38A10-211ENST00000576151 774 ntTSL 216.84■□□□□ 0.291e-8■■■□□ 16.7
GRSF1Q12849 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.171e-8■■■□□ 16.7
GRSF1Q12849 GAPDH-210ENST00000496049 390 ntTSL 215.2■□□□□ 0.021e-8■■■□□ 16.7
GRSF1Q12849 GAPDH-206ENST00000466525 1720 ntTSL 515.09■□□□□ 0.011e-8■■■□□ 16.7
GRSF1Q12849 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -01e-8■■■□□ 16.7
GRSF1Q12849 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.091e-8■■■□□ 16.7
GRSF1Q12849 GAPDH-209ENST00000492719 930 ntTSL 314.36□□□□□ -0.111e-8■■■□□ 16.7
GRSF1Q12849 GAPDH-208ENST00000474249 1333 ntTSL 514.34□□□□□ -0.111e-8■■■□□ 16.7
GRSF1Q12849 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.141e-8■■■□□ 16.7
GRSF1Q12849 SLC38A10-207ENST00000542075 2903 ntTSL 214.1□□□□□ -0.151e-8■■■□□ 16.7
GRSF1Q12849 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.271e-8■■■□□ 16.7
GRSF1Q12849 GAPDH-202ENST00000396856 1266 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.351e-8■■■□□ 16.7
GRSF1Q12849 IBA57-202ENST00000484749 9815 ntTSL 512.81□□□□□ -0.361e-8■■■□□ 16.7
GRSF1Q12849 GAPDH-207ENST00000466588 1363 ntTSL 511.68□□□□□ -0.541e-8■■■□□ 16.7
GRSF1Q12849 EDEM1-205ENST00000465187 585 ntTSL 423.04■■□□□ 1.286e-10■■■□□ 16.6
GRSF1Q12849 EDEM1-206ENST00000465369 1956 ntTSL 522.72■■□□□ 1.236e-10■■■□□ 16.6
GRSF1Q12849 EDEM1-203ENST00000443790 730 ntTSL 221.31■■□□□ 16e-10■■■□□ 16.6
GRSF1Q12849 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.526e-10■■■□□ 16.6
GRSF1Q12849 EDEM1-202ENST00000434243 978 ntTSL 214.2□□□□□ -0.146e-10■■■□□ 16.6
GRSF1Q12849 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.683e-9■■■□□ 16.6
GRSF1Q12849 SLC25A28-204ENST00000496035 744 ntTSL 38.77□□□□□ -1.013e-9■■■□□ 16.6
GRSF1Q12849 RETREG2-207ENST00000452293 609 ntTSL 427.41■■□□□ 1.985e-7■■■□□ 16.5
GRSF1Q12849 RETREG2-201ENST00000273048 2533 ntTSL 1 (best)23.64■■□□□ 1.385e-7■■■□□ 16.5
GRSF1Q12849 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.625e-7■■■□□ 16.5
GRSF1Q12849 RETREG2-205ENST00000443757 558 ntTSL 416.23■□□□□ 0.195e-7■■■□□ 16.5
GRSF1Q12849 RETREG2-208ENST00000458520 992 ntTSL 312.9□□□□□ -0.345e-7■■■□□ 16.5
GRSF1Q12849 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.791e-6■■■□□ 16.5
GRSF1Q12849 GNAI2-205ENST00000441156 2168 ntTSL 223.72■■□□□ 1.391e-6■■■□□ 16.5
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