Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CPSF1Q10570 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CPSF1Q10570 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CPSF1Q10570 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CPSF1Q10570 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CPSF1Q10570 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CPSF1Q10570 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CPSF1Q10570 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CPSF1Q10570 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CPSF1Q10570 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CPSF1Q10570 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CPSF1Q10570 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CPSF1Q10570 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CPSF1Q10570 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
CPSF1Q10570 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CPSF1Q10570 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CPSF1Q10570 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CPSF1Q10570 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC33.82■■■■□ 3
CPSF1Q10570 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CPSF1Q10570 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CPSF1Q10570 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CPSF1Q10570 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CPSF1Q10570 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CPSF1Q10570 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CPSF1Q10570 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CPSF1Q10570 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
CPSF1Q10570 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CPSF1Q10570 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CPSF1Q10570 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CPSF1Q10570 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CPSF1Q10570 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CPSF1Q10570 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
CPSF1Q10570 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
CPSF1Q10570 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CPSF1Q10570 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CPSF1Q10570 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CPSF1Q10570 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CPSF1Q10570 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CPSF1Q10570 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CPSF1Q10570 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CPSF1Q10570 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CPSF1Q10570 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CPSF1Q10570 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CPSF1Q10570 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CPSF1Q10570 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CPSF1Q10570 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CPSF1Q10570 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CPSF1Q10570 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CPSF1Q10570 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CPSF1Q10570 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CPSF1Q10570 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CPSF1Q10570 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CPSF1Q10570 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
CPSF1Q10570 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CPSF1Q10570 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CPSF1Q10570 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CPSF1Q10570 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CPSF1Q10570 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CPSF1Q10570 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CPSF1Q10570 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CPSF1Q10570 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CPSF1Q10570 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CPSF1Q10570 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CPSF1Q10570 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
CPSF1Q10570 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.98
CPSF1Q10570 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
CPSF1Q10570 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CPSF1Q10570 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CPSF1Q10570 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CPSF1Q10570 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CPSF1Q10570 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CPSF1Q10570 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CPSF1Q10570 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CPSF1Q10570 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CPSF1Q10570 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CPSF1Q10570 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CPSF1Q10570 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
CPSF1Q10570 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CPSF1Q10570 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CPSF1Q10570 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
CPSF1Q10570 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CPSF1Q10570 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CPSF1Q10570 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CPSF1Q10570 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CPSF1Q10570 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CPSF1Q10570 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
CPSF1Q10570 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CPSF1Q10570 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CPSF1Q10570 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CPSF1Q10570 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CPSF1Q10570 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
CPSF1Q10570 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CPSF1Q10570 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CPSF1Q10570 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CPSF1Q10570 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CPSF1Q10570 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CPSF1Q10570 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CPSF1Q10570 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CPSF1Q10570 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CPSF1Q10570 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
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