Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCDQ05655 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCDQ05655 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKCDQ05655 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCDQ05655 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCDQ05655 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCDQ05655 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCDQ05655 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCDQ05655 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCDQ05655 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCDQ05655 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKCDQ05655 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCDQ05655 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCDQ05655 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCDQ05655 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRKCDQ05655 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCDQ05655 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCDQ05655 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCDQ05655 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCDQ05655 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCDQ05655 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCDQ05655 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRKCDQ05655 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKCDQ05655 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKCDQ05655 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKCDQ05655 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRKCDQ05655 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKCDQ05655 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKCDQ05655 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms