Protein–RNA interactions for Protein: P17706

PTPN2, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN2P17706 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN2P17706 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN2P17706 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN2P17706 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN2P17706 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN2P17706 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN2P17706 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN2P17706 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN2P17706 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN2P17706 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN2P17706 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN2P17706 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN2P17706 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN2P17706 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN2P17706 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN2P17706 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN2P17706 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN2P17706 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN2P17706 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN2P17706 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN2P17706 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN2P17706 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN2P17706 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN2P17706 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN2P17706 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN2P17706 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN2P17706 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN2P17706 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN2P17706 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN2P17706 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN2P17706 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN2P17706 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPN2P17706 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPN2P17706 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPN2P17706 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPN2P17706 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN2P17706 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN2P17706 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN2P17706 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN2P17706 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN2P17706 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN2P17706 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN2P17706 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN2P17706 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN2P17706 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN2P17706 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN2P17706 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPN2P17706 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPN2P17706 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPN2P17706 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN2P17706 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN2P17706 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN2P17706 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN2P17706 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN2P17706 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN2P17706 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN2P17706 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN2P17706 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN2P17706 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN2P17706 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN2P17706 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN2P17706 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPN2P17706 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPN2P17706 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN2P17706 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN2P17706 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPN2P17706 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN2P17706 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN2P17706 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPN2P17706 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN2P17706 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN2P17706 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN2P17706 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN2P17706 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPN2P17706 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN2P17706 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN2P17706 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN2P17706 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN2P17706 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN2P17706 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPN2P17706 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN2P17706 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN2P17706 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN2P17706 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN2P17706 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN2P17706 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN2P17706 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN2P17706 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN2P17706 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN2P17706 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPN2P17706 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN2P17706 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN2P17706 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN2P17706 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN2P17706 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPN2P17706 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPN2P17706 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN2P17706 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN2P17706 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPN2P17706 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms