Protein–RNA interactions for Protein: P13349

MYF5, Myogenic factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF5P13349 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYF5P13349 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYF5P13349 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYF5P13349 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYF5P13349 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYF5P13349 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYF5P13349 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYF5P13349 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MYF5P13349 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MYF5P13349 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYF5P13349 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYF5P13349 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYF5P13349 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYF5P13349 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYF5P13349 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYF5P13349 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYF5P13349 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYF5P13349 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYF5P13349 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYF5P13349 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYF5P13349 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MYF5P13349 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYF5P13349 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYF5P13349 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYF5P13349 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYF5P13349 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYF5P13349 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYF5P13349 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYF5P13349 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYF5P13349 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYF5P13349 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYF5P13349 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYF5P13349 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYF5P13349 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYF5P13349 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYF5P13349 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYF5P13349 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYF5P13349 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYF5P13349 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYF5P13349 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYF5P13349 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYF5P13349 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYF5P13349 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYF5P13349 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYF5P13349 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYF5P13349 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYF5P13349 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYF5P13349 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYF5P13349 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MYF5P13349 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYF5P13349 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYF5P13349 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYF5P13349 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYF5P13349 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MYF5P13349 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MYF5P13349 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYF5P13349 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYF5P13349 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYF5P13349 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYF5P13349 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYF5P13349 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYF5P13349 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYF5P13349 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYF5P13349 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYF5P13349 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYF5P13349 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYF5P13349 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYF5P13349 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYF5P13349 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYF5P13349 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYF5P13349 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYF5P13349 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYF5P13349 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYF5P13349 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYF5P13349 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYF5P13349 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYF5P13349 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYF5P13349 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYF5P13349 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYF5P13349 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYF5P13349 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYF5P13349 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYF5P13349 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYF5P13349 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYF5P13349 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYF5P13349 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYF5P13349 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYF5P13349 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYF5P13349 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYF5P13349 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYF5P13349 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYF5P13349 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYF5P13349 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYF5P13349 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYF5P13349 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYF5P13349 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYF5P13349 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYF5P13349 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYF5P13349 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYF5P13349 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms